半滑舌鳎细胞分裂周期蛋白42基因克隆与结构预测

细胞分裂周期蛋白42(Cdc42)是Rho超家族酶中的一个亚类，具有调节细胞骨架和肌动蛋白作用，并参与免疫与炎症反应。设计半滑舌鳎Cdc42基因（即CsCdc42）特异性引物，采用RT-PCR方法、生物信息学方法等进行CsCdc42基因克隆及结构预测。结果获得CsCdc42基因片段长度为847 bp，推测编码191个氨基酸，含有7个抗原表位（27-28、61-63、90-92、120-122、131-133、164-166和181-183 aa）、1个RHO结构域（6-179 aa），其中含有1个ATP/GTP结合位点和1个酰基化位点；蛋白结构预测主要为α螺旋（30.9%）、β折叠（24.6%）和无规则卷曲（44.5%）。序列比对结果表明，CsCdc42与斑马鱼、青鳉、虹鳟、大菱鲆和虾等氨基酸序列同源性分别为99.43%、97.91%、95.81%、94.76%和91.10%；构建系统发育树显示Cs Cdc42与斑马鱼、人和海水鱼类Cdc42亲缘关系最近，自然聚为一支。以上结果为研究半滑舌鳎细胞分裂周期蛋白相关基因功能提供科学参考。