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| 猪传染性胃肠炎病毒SCY株3'端8.5kb片段的克隆及序列特征分析 | |
| 引用本文： | 殷华平,郭万柱,宋振辉,孙志勇,徐志文,王小玉,陈进会,杨丽.猪传染性胃肠炎病毒SCY株3''''端8.5kb片段的克隆及序列特征分析[J].畜牧兽医学报,2007,38(1):66-71. |
| 作者姓名： | 殷华平 郭万柱 宋振辉 孙志勇 徐志文 王小玉 陈进会 杨丽 |
| 作者单位： | 1. 四川农业大学动物生物技术中心,雅安,625014 2. 广东东莞市出入境检验检疫局,东莞,523072 3. 四川农业大学动物科技学院,雅安,625014 |
| 基金项目： | 教育部长江学者和创新团队发展计划(IRT0555) |
| 摘 要： | 根据GenBank的核酸序列,设计6对引物自TGEV SCY株中分别扩增了长为1.5 kb、2.0 kb、1.1 kb、1.4 kb、1.4 kb、1.3 kb的6个片段,经克隆测序拼接后获得8 495 bp的TGEV部分序列.根据与其他TGEV和冠状病毒的序列和结构特征比较表明,该段序列克隆了除TGEV聚合酶基因以外的S、M、N、E、NSP3a、NSP3b、ORF7共7个基因的核酸序列;根据S、M、N基因的序列构建了系统进化树,分析表明TGEV-SCY株与TS、HN2002、TO14、pudue等毒株亲缘关系较近;密码子偏爱性分析结果认为TGEV在对密码子的使用上存在轻微的偏向性,个别氨基酸偏向于选择以A和T结尾的密码子. |
| 关 键 词： | 猪传染性胃肠炎病毒(TGEV) M基因 S基因 N基因 克隆 生物信息学 |
| 文章编号： | 0366-6964(2007)01-0066-06 |
| 修稿时间： | 2006年4月8日 |
Cloning and Analysis of a 8.5 kb Sequence from the 3' End of Transmissible Gastroenteritis Virus Genome |
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| YIN Hua-ping,GUO Wan-zhu,SONG Zhen-hui,SUN Zhi-yong,XU Zhi-wen,WANG Xiao-yu,CHEN Jin-hui,YANG Li.Cloning and Analysis of a 8.5 kb Sequence from the 3'''' End of Transmissible Gastroenteritis Virus Genome[J].Acta Veterinaria et Zootechnica Sinica,2007,38(1):66-71. | |
| Authors: | YIN Hua-ping GUO Wan-zhu SONG Zhen-hui SUN Zhi-yong XU Zhi-wen WANG Xiao-yu CHEN Jin-hui YANG Li |
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