枣树novel-miR16靶基因ZjTCP4鉴定及生物信息学分析

TCPs转录因子主要通过调节细胞增殖和植物激素途径来调控植物器官发生和形态构型，探究枣树ZjTCP4转录因子的序列特征及其表达特性，以期为TCP转录因子响应干旱胁迫的机理研究提供参考，也可以为后续对枣树分子育种奠定基础。novel-miR16的二级结构具有miRNA典型的发夹结构，为枣树miR319家族成员；靶基因ZjTCP4的降解位点多数都在novel-miR16结合位点的第10和11个核苷酸的位置；生物信息学分析表明，ZjTCP4基因的全长cDNA序列为1 386 bp,预测编码452个氨基酸的多肽，预测编码蛋白的等电点(pI)为6.51,分子量为49 091.55 u;应该是一个膜内或膜外蛋白，为非分泌性蛋白，为亲水性蛋白质，定位于细胞核；枣树ZjTCP4基因编码的氨基酸序列与拟南芥AtTCP4最为相似，与拟南芥AtTCP17,AtTCP18和AtTCP12的相似性也较高；枣树novel-miR16在响应干旱胁迫的过程中上调表达，而其靶基因ZjTCP4在干旱胁迫下下调表达。枣树novel-miR16通过靶向调控ZjTCP4转录因子响应干旱胁迫，干旱胁迫下枣树novel-miR16...