拟南芥转录因子CBF2的克隆与生物信息学分析

本研究旨在克隆转录因子CBF2并对其进行生物信息学分析得到该基因相关信息。试验以拟南芥基因组DNA为模板，根据GenBank中拟南芥转录因子CBF2(FJ491243.1)已知序列设计引物，回收扩增的目的片段与T-easy载体连接后转入大肠杆菌(E.coli DH5α)，经蓝白斑筛选后提取重组体的质粒，经滞后筛选、PCR、酶切鉴定无误后进行测序。经生物信息学分析，该基因全长651 bp，其中编码区长648 bp，编码216个氨基酸，其蛋白的分子式为C₁₀₅₆H₁₆₂₃N₂₉₃O₃₃₃S₁₆，相对分子质量为24.26 kDa，等电点为5.00，该蛋白为亲水性非分泌型蛋白，无信号肽存在；其蛋白质二级结构以α-螺旋、β-折叠和无规卷曲为主。肽链可能含有9处丝氨酸磷酸化位点，6处苏氨酸磷酸化位点，以及2处酪氨酸磷酸化位点。本研究通过对CBF2基因的生物信息学分析，获得了该基因的相关信息，并与已有研究结果进行比对分析，推测该基因在植物抗逆过程中有重要的作用。