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菰SRAP-PCR反应体系的优化与建立
引用本文:任绪瑞,刘艳玲,杨美,陈媛媛,王冬良,陈友根. 菰SRAP-PCR反应体系的优化与建立[J]. 热带作物学报, 2014, 35(2): 299-306
作者姓名:任绪瑞  刘艳玲  杨美  陈媛媛  王冬良  陈友根
作者单位:1 安徽农业大学园艺学院2 中国科学院武汉植物园水生植物与流域生态重点实验室;中国科学院武汉植物园水生植物与流域生态重点实验室;中国科学院武汉植物园水生植物与流域生态重点实验室;中国科学院武汉植物园水生植物与流域生态重点实验室;安徽农业大学园艺学院;安徽农业大学园艺学院
基金项目:“安徽省农业综合开发项目《蔬菜新品种引进与示范》” (No. 11003258)。
摘    要:利用单因素分析法对影响菰SRAP-PCR扩增效果的Mg2+、dNTPs、Taq DNA聚合酶、DNA模板和引物浓度5种因素进行了优化。结果表明:建立了适合菰基因组的SRAP-PCR的体系:1μL 10×Buffer、0.5 U Taq DNA聚合酶、2 mmol/L MgCl2、50 ng模板DNA、0.20 mmol/L dNTPs、正反向引物的浓度各为0.7μmol/L,共10μL。选取5对引物,利用该体系对72份菰样本进行PCR扩增,共获得132条清晰的谱带,其中91条具有多态性,比率为68.9%。菰SRAP-PCR反应体系的优化和建立将为利用该标记进行种质遗传多样性分析和连锁图谱构建等研究提供技术支持。

关 键 词:菰;SRAP;PCR反应体系;优化

Optimization and Establishment of SRAP-PCR in Zizania latifolia
REN Xurui,LIU Yanling,YANG Mei,CHEN Yuanyuan,WANG Dongliang and CHEN Yougen. Optimization and Establishment of SRAP-PCR in Zizania latifolia[J]. Chinese Journal of Tropical Crops, 2014, 35(2): 299-306
Authors:REN Xurui  LIU Yanling  YANG Mei  CHEN Yuanyuan  WANG Dongliang  CHEN Yougen
Affiliation:1 College of Horiiculture, Anhui Agricultural University2 Key Laboratory of Aquatic Plant and Watershed Ecology, Wuhan Botanical Garden, Chinese Academy of Sciences;Key Laboratory of Aquatic Plant and Watershed Ecology, Wuhan Botanical Garden, Chinese Academy of Sciences;Key Laboratory of Aquatic Plant and Watershed Ecology, Wuhan Botanical Garden, Chinese Academy of Sciences;Key Laboratory of Aquatic Plant and Watershed Ecology, Wuhan Botanical Garden, Chinese Academy of Sciences;College of Horiiculture, Anhui Agricultural University;College of Horiiculture, Anhui Agricultural University
Abstract:
Keywords:Zizania latifolia   SRAP   PCR reaction system   Optimization
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