| 巨魾线粒体ND3,tRNA-Arg 和ND4L 基因克隆及多态性分析 |
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| 引用本文： | 杜民,叶德来,牛宝珍,段加明,岳冉,宋桃稳,王文涛,刘艳红. 巨魾线粒体ND3,tRNA-Arg 和ND4L 基因克隆及多态性分析[J]. 西南大学学报(自然科学版), 2017, 39(12): 32-37 |
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| 作者姓名： | 杜民 叶德来 牛宝珍 段加明 岳冉 宋桃稳 王文涛 刘艳红 |
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| 作者单位： | 1. 红河学院 云南省高校农作物优质高效栽培与安全控制重点实验室, 云南 蒙自 661199;2. 红河学院 生命科学与技术学院, 云南 蒙自 661199 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目(31360638);云南省教育厅科学研究基金重大专项项目(ZD2013009);云南省中青年学术带头人后备人才项目(2015HB059);红河学院创新性实践教学改革试点项目; 大学生创新创业实践训练平台建设(CXSJ1340);红河学院中青年学术带头人后备人才项目(2014HB0203);红河学院博士专项项目(14bs11) |
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| 摘 要： | 为了解巨魾鱼的种质资源情况,采用PCR技术扩增克隆并测序,得到巨魾NADH dehydrogenase subunit-3(ND3),精氨酸的转运RNA(tRNA-Arg)和NADH dehydrogenase subunit-4L(ND4L)基因全序列各12条.通过DNAMAN 5.2.2软件进行序列比对,采用MEGA 5.02软件进行碱基质量分数分析,计算遗传距离,并构建系统发育树.结果表明:巨魾鱼ND3基因序列全长为346bp,碱基质量分数A为26.2%,T为29.6%,C为28.8%,G为15.4%,其中A+T质量分数(55.8%)高于G+C质量分数(44.2%),12个ND3基因序列存在5种单倍型,发生了5次转换,1次颠换,5种单倍型之间平均相对遗传距离为0.007;tRNA-Arg基因序列全长为71bp,碱基质量分数A为23.9%,T为23.9%,C为29.6%,G为22.6%,其中A+T质量分数(47.8%)低于G+C质量分数(52.2%),12个基因序列完全一致;ND4L基因序列全长为297bp,起始密码子为ATG,终止密码子为TAA,碱基质量分数A为24.6%,T为26.3%,C为33.3%,G为15.8%,其中A+T质量分数(50.9%)高于G+C质量分数(49.1%),12个基因序列完全一致;将巨魾鱼与鮡科的其他10种鱼类的ND3,tRNA-Arg和ND4 L基因用Minimum Evolution法(ME)构建系统发育树,发现12尾巨魾鱼单独聚为一支,这一结果与传统的形态学分类相似.
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| 关 键 词： | 巨魾； ND3； tRNA-Arg； ND4L； 序列分析； 系统发育； |
Cloning and Polymorphism Analysis of Mitochondrial ND3, tRNA-Arg and ND4L Genes of Bagarius yarrelli |
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| DU Min,YE De-lai,NIU Bao-zhen,DUAN Jia-ming,YUE Ran,SONG Tao-wen,WANG Wen-tao,LIU Yan-hong. Cloning and Polymorphism Analysis of Mitochondrial ND3, tRNA-Arg and ND4L Genes of Bagarius yarrelli[J]. Journal of southwest university (Natural science edition), 2017, 39(12): 32-37 |
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| Authors: | DU Min YE De-lai NIU Bao-zhen DUAN Jia-ming YUE Ran SONG Tao-wen WANG Wen-tao LIU Yan-hong |
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