不同播期条件下大豆开花期性状的全基因组关联分析 |
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作者姓名: | 宋晓宇 毛婷婷 王立伟 刘丽凤 李晓那 孙石 韩天富 |
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作者单位: | 1 .东北农业大学农学院,黑龙江哈尔滨,150030;2 .中国农业科学院作物科学研究所,北京,100081;3. 鲁东大学,山东 烟台,264025 |
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基金项目: | 国家重点研发计划(2017YFD0101400);国家现代农业产业技术体系建设专项(CARS-04);中国农业科学院农业科技创新工程 |
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摘 要: | 开花期是决定大豆生态适应性和产量的重要性状,研究大豆开花期的遗传规律,解析大豆开花调控的分子基础,对大豆品种适应性改良具有重要意义。本研究选用来自北方、黄淮海和南方三大生态区的87份中国品种及31份美国大豆品种,在北京进行春、夏季分期播种,获得10个播期环境下的开花期数据,并利用Illumina BARCSoySNP6K iSelectBeadChip芯片对大豆品种进行SNP分型。通过群体结构分析、聚类分析和PCA分析,将供试大豆品种分为两个亚群。利用TASSEL软件PCA+K模型,结合5 126个SNP标记,对开花期进行全基因关联分析,得到18个显著关联位点,其中14个位点在2个以上的环境中稳定表达,4个位点只在单一环境中被检测到,表明其受光温环境影响较大。通过对显著关联位点进行预测,共发现31个候选基因,其中有2个(Glyma10g36600和Glyma19g37890)已在此前的研究中被证明与大豆开花有关,而Glyma03g33470、Glyma11g15650、Glyma05g01510和Glyma19g07162与拟南芥中相关的开花调控基因同源,推测这4个基因在大豆中也参与开花调控。11个尚未见报道的新位点分别位于3、4、5、9、10、14、16和17号染色体上,可能存在控制大豆开花期的新基因。
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关 键 词: | 大豆 开花期 全基因组关联分析 候选基因 |
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