不同播期条件下大豆开花期性状的全基因组关联分析

开花期是决定大豆生态适应性和产量的重要性状，研究大豆开花期的遗传规律，解析大豆开花调控的分子基础，对大豆品种适应性改良具有重要意义。本研究选用来自北方、黄淮海和南方三大生态区的87份中国品种及31份美国大豆品种，在北京进行春、夏季分期播种，获得10个播期环境下的开花期数据，并利用Illumina BARCSoySNP6K iSelectBeadChip芯片对大豆品种进行SNP分型。通过群体结构分析、聚类分析和PCA分析，将供试大豆品种分为两个亚群。利用TASSEL软件PCA+K模型，结合5 126个SNP标记，对开花期进行全基因关联分析，得到18个显著关联位点，其中14个位点在2个以上的环境中稳定表达，4个位点只在单一环境中被检测到，表明其受光温环境影响较大。通过对显著关联位点进行预测，共发现31个候选基因，其中有2个（Glyma10g36600和Glyma19g37890）已在此前的研究中被证明与大豆开花有关，而Glyma03g33470、Glyma11g15650、Glyma05g01510和Glyma19g07162与拟南芥中相关的开花调控基因同源，推测这4个基因在大豆中也参与开花调控。11个尚未见报道的新位点分别位于3、4、5、9、10、14、16和17号染色体上，可能存在控制大豆开花期的新基因。