| 棉花WRKY转录因子家族成员的鉴定和生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 张书玲§,刘莹§,张惠敏,刘浩然,董丽君,刘紫欣,刘建凤. 棉花WRKY转录因子家族成员的鉴定和生物信息学分析[J]. 中国农业科技导报, 2017, 19(8): 9-15. DOI: 10.13304/j.nykjdb.2016.668 |
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| 作者姓名： | 张书玲§ 刘莹§ 张惠敏 刘浩然 董丽君 刘紫欣 刘建凤 |
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| 作者单位： | 1.河北大学生命科学学院, 河北 保定 071002; 2.中国农业科学院生物技术研究所, 北京 100081 |
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| 基金项目： | 河北省自然科学基金项目（C2015201227）；河北大学自然科学研究计划项目（2014-277）资助。 |
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| 摘 要： | WRKY转录因子家族在植物抵御各种生物、非生物胁迫反应和生长发育调控中扮演着重要角色。利用生物信息学方法鉴定和分析棉花A基因组WRKY转录因子,共鉴定得到109个候选WRKY基因,编码区全长474~3 528 bp,基因分布在棉花13条染色体上。依据WRKY家族基因的保守结构域和系统进化关系,将其划分为3个大组:G1组、G2组和G3组。G1组WRKY基因包括21个成员,其中18个含有两个WRKY域;G2组有73个成员,可进一步分为G2-a、G2-b、G2-c、G2-d和G2-e五个亚类;G3组WRKY基因包括15个成员。同组的WRKY成员保守域的氨基酸构成大体相似,但也存在WRKYGQK多肽和锌指结构的变异,不同组成员的氨基酸保守域组成特异。拟南芥和棉花WRKY基因的系统进化树表明,功能相似的基因聚在一起,暗示和拟南芥抗逆功能基因聚类在一起Ga WRKY可能参与棉花抵御逆境胁迫反应,为进一步发现和挖掘棉花WRKY基因的功能奠定理论基础。
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| 关 键 词： | 棉花 WRKY 鉴定 进化分析 |
Genome-wide Identification and Analysis of WRKYTranscription Factors in G. arboretum |
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| ZHANG Shuling§,LIU Ying§,ZHANG Huimin,LIU Haoran,DONG Lijun. Genome-wide Identification and Analysis of WRKYTranscription Factors in G. arboretum[J]. Journal of Agricultural Science and Technology, 2017, 19(8): 9-15. DOI: 10.13304/j.nykjdb.2016.668 |
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| Authors: | ZHANG Shuling§ LIU Ying§ ZHANG Huimin LIU Haoran DONG Lijun |
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| Affiliation: | 1.College of Life Science, Hebei University, Hebei Baoding 071002; 2.Biotechnology Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing 100081, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | cotton WRKY identification evolution analysis |
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