| 采用基于高分辨率熔解曲线技术的SNP标记定位徐州142无絮的短绒控制基因 |
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| 引用本文： | 吴春珲,马启峰,李海晶,王文魁,裴文锋,李兴丽,吴嫚,张金发,于霁雯. 采用基于高分辨率熔解曲线技术的SNP标记定位徐州142无絮的短绒控制基因[J]. 棉花学报, 2017, 29(1): 1-8. DOI: 10.11963/issn.1002-7807.201701001 |
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| 作者姓名： | 吴春珲 马启峰 李海晶 王文魁 裴文锋 李兴丽 吴嫚 张金发 于霁雯 |
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| 作者单位： | 中国农业科学院棉花研究所/棉花生物学国家重点实验室,河南安阳,455000 |
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| 基金项目： | 国家863计划(2013AA102601-01-14)，国家科技支撑计划(2014BAD03B01) |
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| 摘 要： | 【目的】定位徐州142无絮(XZ142w)突变体的短绒控制基因n2。【方法】以陆地棉(Gossypium hirsutum L.)徐州142(XZ142)×XZ142w的F2群体为研究对象,利用108个简单重复序列(Simple sequence repeat,SSR)标记对n2进行初步定位,再根据2个亲本材料中有单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphic,SNP)的差异基因设计50对SNP引物,用高分辨率熔解曲线(High resolution melting,HRM)技术从中筛选在亲本间有多态性的SNP引物,并用于后代的基因分型。【结果】利用108个SSR标记将n2初步定位在26号染色体的20.2c M的遗传区间内;用HRM技术筛选到9对亲本间有多态性的SNP引物,成功实现基因分型;并结合以SSR构建的连锁图谱,将n2的遗传区间缩小为19.5 c M,n2与最近的SNP标记Cricaas20158遗传距离为5.5 c M,且遗传图谱上的标记与四倍体陆地棉测序物理图谱基本一致。【结论】HRM技术可用于棉花中的SNP检测和n2基因的定位。
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| 关 键 词： | 陆地棉 高分辨率熔解曲线 单核苷酸多态性 简单重复序列 棉纤维 基因定位 |
Genetic Mapping of a Fuzzless Mutant Gene in Upland Cotton (Gossypium hirsutum L.) Using High Resolution Melting-Based Single Nucleotide Polymorphism Markers |
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| Wu Chunhui,Ma Qifeng,LI Haijing,Wang Wenkui,Pei Wenfeng,Li Xingli,Wu Man,Zhang Jinfa,Yu Jiwen,Yu Shuxun. Genetic Mapping of a Fuzzless Mutant Gene in Upland Cotton (Gossypium hirsutum L.) Using High Resolution Melting-Based Single Nucleotide Polymorphism Markers[J]. Cotton Science, 2017, 29(1): 1-8. DOI: 10.11963/issn.1002-7807.201701001 |
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| Authors: | Wu Chunhui Ma Qifeng LI Haijing Wang Wenkui Pei Wenfeng Li Xingli Wu Man Zhang Jinfa Yu Jiwen Yu Shuxun |
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| Affiliation: | Institute of Cotton Research, Chinese Academy of Agricultural Sciences / State Key Laboratory of Cotton Biology, Anyang, Henan 455000, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | upland cotton high resolution melting single nucleotide polymorphism simple sequence repeat cotton fiber gene mapping |
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