| 龙眼MSIL全基因组鉴定及表达分析 |
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| 引用本文： | 许小琼,陈晓慧,申序,徐小萍,林玉玲,赖钟雄. 龙眼MSIL全基因组鉴定及表达分析[J]. 热带作物学报, 2019, 40(10): 1938-1948. DOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2019.10.006 |
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| 作者姓名： | 许小琼 陈晓慧 申序 徐小萍 林玉玲 赖钟雄 |
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| 作者单位： | 福建农林大学园艺植物生物工程研究所,福建福州 350002 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目(31572088);福建省高原学科建设经费(102/71201801101);福建农林大学科技创新专项基金(CXZX2017314) |
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| 摘 要： | MSIL（Muliticopy suppressor of IRA homolog1-Like）基因是WD重复蛋白的一个亚家族,在植物生长发育过程中发挥重要的作用。为了解龙眼MSIL（DlMSIL）基因家族的生物学功能,本研究基于基因组和转录组数据,采用生物信息学分析法对DlMSIL基因成员进行鉴定,并进行蛋白质结构及理化性质分析、系统发育进化树构建、启动子顺式作用元件分析、龙眼体胚阶段和不同组织器官表达情况以及GA3处理下的定量表达分析。结果表明：DlMSIL基因家族含有6个成员属于WD40和CAF1C_H4-bd超家族,可分为3类;DlMSIL蛋白编码393~551 aa,等电点为4.68~7.62,该家族成员均不属于分泌蛋白;基因家族成员的内含子数目在4~14之间;DlMSIL启动子序列包含大量非生物胁迫响应元件及MYB结合位点,推测DlMSIL基因家族可能参与多种非生物胁迫反应;DlMSIL可能参与不同胚胎的发育过程和不同组织器官的形态建成。GA3处理下的表达分析显示高浓度时,DlMSI1a与DlMSI1c的表达受到了一定的抑制,而DlMSI4a的表达量呈现先下降后上升再下降的趋势,推测DlMSIL可能参与激素响应途径。本研究表明,DlMSIL基因家族成员可能参与胚胎发育、激素信号通路以及非生物胁迫反应等多种生物学功能,体现了龙眼MSIL基因家族功能具有多样性。
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| 关 键 词： | 龙眼 体胚 MSIL 生物信息学分析 qPCR |
| 收稿时间： | 2019-07-30 |
Genome-wide Identification and Expression Analysis of MSIL Gene Family During Somatic Embryogenesis in Dimocarpus longan Lour. |
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| XU Xiaoqiong,CHEN Xiaohui,SHEN Xu,XU Xiaoping,LIN Yuling,LAI Zhongxiong. Genome-wide Identification and Expression Analysis of MSIL Gene Family During Somatic Embryogenesis in Dimocarpus longan Lour.[J]. Chinese Journal of Tropical Crops, 2019, 40(10): 1938-1948. DOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2019.10.006 |
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| Authors: | XU Xiaoqiong CHEN Xiaohui SHEN Xu XU Xiaoping LIN Yuling LAI Zhongxiong |
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| Affiliation: | Institute of Horticultural Bioengineering, Fujian Agriculture and Forestry University, Fuzhou, Fujian 350002, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Dimocarpus longan Lour. somatic embryo MSIL (Multicopy suppressor of IRA homolog1-like gene) bioinformatics analysis qPCR |
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