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剑麻内参基因筛选与稳定表达分析
引用本文:张燕梅,王瑞芳,杨子平,鹿志伟,李俊峰,赵艳龙,陆军迎,周文钊. 剑麻内参基因筛选与稳定表达分析[J]. 热带作物学报, 2019, 40(11): 2166-2173. DOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2019.11.010
作者姓名:张燕梅  王瑞芳  杨子平  鹿志伟  李俊峰  赵艳龙  陆军迎  周文钊
作者单位:中国热带农业科学院南亚热带作物研究所/湛江市热带作物遗传改良重点实验室,广东湛江 524091
基金项目:国家自然科学基金项目(31401427);国家麻类产业技术体系项目(CARS-16);广东省甘蔗剑麻产业技术体系创新团队(2019KJ104-03)
摘    要:为了筛选剑麻中稳定表达的内参基因,保证基因表达结果的可靠性,本研究以热麻1号为材料,采用实时荧光定量RT-PCR方法对来自剑麻转录组数据的8个内参基因(EF1αMADHACT2GAPDHTUBACT54CYPEF1β)在烟草疫霉侵染、水杨酸(SA)、茉莉酸甲酯(MeJA)和脱落酸(ABA)处理过程中的表达水平进行检测,并结合GeNorm、BestKeeper和NormFinder软件综合评价8个内参基因的稳定性。结果表明:8个内参基因在不同处理下的表达稳定性存在显著差异,其中在烟草疫霉侵染和茉莉酸甲酯处理过程中,EF1α表达最稳定,EF1β表达最不稳定。在水杨酸处理过程中,EF1α表达最稳定,ACT2表达最不稳定。在脱落酸处理过程中,GAPDH表达最稳定,ACT54表达最不稳定。该结果为剑麻基因的表达分析提供了可供选择的内参基因。

关 键 词:剑麻  定量RT-PCR  内参基因  
收稿时间:2019-02-09

Screening of Suitable Reference Genes for qRT-PCR Normalization in Sisal
ZHANG Yanmei,WANG Ruifang,YANG Ziping,LU Zhiwei,LI Junfeng,ZHAO Yanlong,LU Junying,ZHOU Wenzhao. Screening of Suitable Reference Genes for qRT-PCR Normalization in Sisal[J]. Chinese Journal of Tropical Crops, 2019, 40(11): 2166-2173. DOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2019.11.010
Authors:ZHANG Yanmei  WANG Ruifang  YANG Ziping  LU Zhiwei  LI Junfeng  ZHAO Yanlong  LU Junying  ZHOU Wenzhao
Affiliation:South Subtropical Crops Research Institute, Chinese Academy of Tropical Agricultural Sciences / Zhanjiang City Key Laboratory for Tropical Crops Genetic Improvement, Zhanjiang, Guangdong 524091, China
Abstract:
Keywords:sisal  qRT-PCR  reference gene  
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