粒用高粱glutelin基因的表达与进化分析 |
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引用本文: | 赵珊珊,董琳琳,柴文婷,杨博慧,孙慧琼,王新宇,刘卓君,郭子浩,史小霞,郝昱宁,朱立勋,邹春雷,姜晓东,赵威军,吕晋慧,张春来.粒用高粱glutelin基因的表达与进化分析[J].山西农业科学,2023(10):1127-1135. |
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作者姓名: | 赵珊珊 董琳琳 柴文婷 杨博慧 孙慧琼 王新宇 刘卓君 郭子浩 史小霞 郝昱宁 朱立勋 邹春雷 姜晓东 赵威军 吕晋慧 张春来 |
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作者单位: | 1. 山西农业大学农学院/教育部省部共建黄土高原特色作物高效生产协同创新中心;2. 山西农业大学高粱研究所;3. 山西农业大学林学院 |
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基金项目: | 国家自然科学基金项目(31971994); |
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摘 要: | 高粱glutelin是一种储藏蛋白,存在于水稻、玉米等禾谷类作物的籽粒中,是不溶于纯水、中性的盐溶液或酒精,但溶于稀碱或稀酸的蛋白质总称。为进一步研究高粱glutelin功能,改善籽粒品质提供基础,通过BLAST Phytozome数据库获得高粱glutelin的DNA和氨基酸序列数据,结合生物信息学方法鉴定到SbGLUA1(Sobic.001G143700)、SbGLUA2(Sobic.009G017600)、SbGLUB4(Sobic.009G007100)基因,并对高粱glutelin基因家族信息、基因结构、系统进化树、glutelin不同基因型各组织表达以及glutelin蛋白质理化性质、跨膜、二级结构、三级结构、蛋白互作关系进行分析。结果表明,glutelin蛋白大多不是分泌性蛋白,是亲水蛋白且流动性较差,SbGLUB4的二级结构主要是无规则卷曲和α-螺旋。glutelin蛋白结构域分析结果显示,大多蛋白较为保守;高粱glutelin与小麦谷蛋白同源性较高。SbGLUB4为种子专性表达,且随种子成熟度程度的增加而增加;各基因表达在品种间存在差异,IS22204较Laohany...
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关 键 词: | 高粱 glutelin 生物信息学分析 基因表达 系统进化 |
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