赤水乌骨鸡ExFABP基因序列生物信息学及组织表达分析 |
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引用本文: | 吴芸,欧正淼,李秋玉,陈粉粉,闫吉美.赤水乌骨鸡ExFABP基因序列生物信息学及组织表达分析[J].中国畜牧杂志,2023(12):161-165. |
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作者姓名: | 吴芸 欧正淼 李秋玉 陈粉粉 闫吉美 |
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作者单位: | 1. 遵义师范学院生物与农业科技学院;2. 西南林业大学生命科学学院 |
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摘 要: | 本研究旨在对赤水乌骨鸡的ExFABP基因编码区(Coding Sequence,CDS)序列进行测序及生物信息学分析,检测其在不同组织中的表达,探究ExFABP对赤水乌骨鸡肉质性能的影响。运用RT-PCR对赤水乌骨鸡ExFABP基因的编码区序列进行扩增测序,并对其氨基酸序列进行生物学特性分析,构建物种进化树揭示亲缘关系,同时通过实时荧光定量PCR检测了赤水乌骨鸡不同组织中ExFABP的差异表达情况。结果显示,赤水乌骨鸡ExFABP基因编码区长537 bp,编码178个氨基酸。赤水乌骨鸡ExFABP编码氨基酸序列与原鸡的同源性最高,达到100%。系统进化树分析表明,赤水乌骨鸡与原鸡的亲缘关系最近。ExFABP基因在各组织中均有表达,在肺脏中的表达量最高,显著高于其他组织,在胸肌中的表达量最低。研究结果为进一步研究改善赤水乌骨鸡肉品质、风味提供基础材料。
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关 键 词: | 赤水乌骨鸡 ExFABP基因 生物信息学分析 组织表达 |
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