番茄斑萎病毒属ssRNA-M序列比对分析 |
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引用本文: | 刘雅婷,李鑫,李永忠,李正跃,李成云,朱有勇.番茄斑萎病毒属ssRNA-M序列比对分析[J].西南大学学报,2009,31(12). |
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作者姓名: | 刘雅婷 李鑫 李永忠 李正跃 李成云 朱有勇 |
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作者单位: | 1. 云南农业大学,农学与生物技术学院,昆明,650201;云南农业大学,植物保护学院,昆明,650201 2. 云南农业大学,农学与生物技术学院,昆明,650201 3. 云南农业大学,烟草学院,昆明,650201 4. 云南农业大学,植物保护学院,昆明,650201 |
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基金项目: | 国家973资助项目,云南省自然科学基金资助项目,云南省教育厅自然科学基金资助项目 |
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摘 要: | 番茄斑萎病毒属(Tospovirus)是布尼亚病毒科唯一的植物病毒属,在热带、亚热带以及温带地区引起许多作物和花卉严重病害的发生.该研究利用DNAstar、DNAman等软件对其RNA-M编码G1G2蛋白和NSm非结构蛋白的核酸和蛋白质序列进行分析,发现Tospovirus属病毒的G1G2蛋白和NSm非结构蛋白序列的长度和GC含量在不同病毒种间变异不大,同时得出序列比对图和一致性(Identity)的值、同源性(Homolog tree)的值和系统进化树(Phylogenetic tree)的值,并发现根据NSm蛋白质序列划分的2个相似性组与前人划分的血清组非常接近.
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关 键 词: | 番茄斑萎病毒属 DNAman DNAstar GP糖蛋白 非结构蛋白 |
Sequence Alignment and Analysis of the ssRNA-M of Tospovirus |
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Abstract: | |
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Keywords: | Tospovirus DNAman DNAstar G1G2 NSm |
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