基于第二代转录组、第三代全长转录组测序条件下草石蚕基因表达特性的初步研究

以宁夏贺兰县地方草石蚕（Stachys sieboldii）品种为试材，探讨应用第三代测序技术获得草石蚕全长转录本信息，应用第二代测序技术获得3个不同发育阶段草石蚕叶片和块茎的转录组信息，对测序结果进行转录组水平分析，筛选特有差异基因，并进行GO和KEGG富集分析，开展草石蚕基因表达特性的初步研究。结果表明，第三代测序后Polymerase read的数据量为50.82 G,FLNC序列的reads数为525 593个转录本；在KEGG等7大数据库的基因功能注释中均注释成功的转录本数目为6 857个，至少有1个数据库注释成功的转录本数目为14 078个；与NR数据库比对注释后，草石蚕与同为唇形目的芝麻（Sesamum indicum）基因序列相似性最高，相似基因个数为9 149个；与GO数据库比对注释后，生物学过程、细胞成分与分子功能中注释到基因个数最多的分别是新陈代谢过程5 093个、细胞2 004个、键联结合6 645个；与KEGG数据库比对注释后，在细胞转化、环境信息处理、遗传信息处理、新陈代谢和有机系统功能中注释到基因数最多的分别是运输和分解代谢409个、信号传导729个、转化...