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| 猪圆环病毒2型贵州株ORF1基因的生物信息学分析 | |
| 引用本文： | 杨利勇,李春凤,周继勇.猪圆环病毒2型贵州株ORF1基因的生物信息学分析[J].贵州农业科学,2015(6). |
| 作者姓名： | 杨利勇 李春凤 周继勇 |
| 作者单位： | 1. 浙江大学 动物科学学院，浙江 杭州 310058; 贵州福斯特生物科技有限公司，贵州 贵阳 550014 2. 贵州福斯特生物科技有限公司,贵州 贵阳,550014 3. 浙江大学 动物科学学院,浙江 杭州,310058 |
| 基金项目： | 贵州省农业委员会项目“贵州省猪圆环病毒病流行病学调查研究” |
| 摘 要： | 为了解猪圆环病毒2型贵州株(PCV2-GZ)ORF1基因的生物学特性,针对ORF1基因设计1对特异性引物,取PCV2阳性病料DNA为模板进行PCR扩增,克隆测序后进行生物信息学分析。结果表明:PCV2-GZ ORF1基因序列与GenBank登录的14株PCV2(06-06274,CC1,HUB-5,HUN-11,JX-1,LN-3,P710-1,PCV2HERD D,SC-10,SVP-321,SX-1,VOS 2689006,ZJ-38,N1)相应序列核苷酸的同源性为96.8%~99.7%,与国内HUB-5和ZJ-38的同源性最高,均为99.7%;PCV2-GZ编码的Rep蛋白与P710-1、HUB-5、SC-10、ZJ-38株的氨基酸序列同源性较高,均为99.4%。PCV2-GZ Rep蛋白可形成优势抗原表位,且不存在跨膜结构和信号肽,推测可进行PCV2 ORF1基因的全基因表达。 |
| 关 键 词： | 猪圆环病毒 2 型 ORF1 基因 生物信息学 贵州 |
Bioinformatics Analysis of ORF 1 Gene of Porcine Circovirus Type 2 in Guizhou |
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| YANG Liyong,LI Chunfeng,ZHOU Jiyong.Bioinformatics Analysis of ORF 1 Gene of Porcine Circovirus Type 2 in Guizhou[J].Guizhou Agricultural Sciences,2015(6). | |
| Authors: | YANG Liyong LI Chunfeng ZHOU Jiyong |
| Abstract: | |
| Keywords: | Porcine circovirus type 2 ORF1 gene bioinformation Guizhou |
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