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长雄野生稻地下茎cDNA文库的构建及EST分析
作者姓名:林海妹  郭安平  王晓玲  郭运玲  孔华  贺立卡
作者单位:中国热带农业科学热带生物技术研究所,农业部热带作物生物技术重点开放实验室,海口,571101;海南大学农学院,海口,570228;中国热带农业科学热带生物技术研究所,农业部热带作物生物技术重点开放实验室,海口,571101;江西省农业科学院水稻研究所,南昌,330200
基金项目:中央级公益性科研院所基本科研业务专项基金 
摘    要:长雄野生稻(Oryza longisatminata)是广泛生长在热带非洲的1个野生种,具有明显的地下茎特征.为了探索控制其地下茎发育的相关基因及其他优异基因,初步构建了地下茎cDNA文库.文库指标显示:初始滴度为2.5×105cfu/μg,扩增滴度为2.9x108cfu/μg,库容为5x106cfu,重组率为82%;随机挑选80个单克隆进行测序,插入片段在400~1 000bp之间;对测序结果进行比对分析,获得了58个已报道有一定功能的EST序列,22个未见报道的EST序列;并利用PAUP4.0软件对序列进行了筛选分析.

关 键 词:长雄野生稻  地下茎  cDNA文库
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