鹌鹑核酸序列中的微卫星标记分析 |
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引用本文: | 白俊艳,赵淑娟,庞有志.鹌鹑核酸序列中的微卫星标记分析[J].江苏农业科学,2010(4). |
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作者姓名: | 白俊艳 赵淑娟 庞有志 |
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作者单位: | 河南科技大学动物科技学院,河南郑州,471003 |
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基金项目: | 河南省科技攻关项目,河南科技大学校青年科学研究基金 |
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摘 要: | 在已公布的鹌鹑核酸序列和EST序列总计635条序列的1~6核苷酸重复SSR的分布中,共发现120条SSR,检出率为18.9%.二核苷酸重复基元的SSR占40.0%,三核苷酸重复基元的SSR占35.8%,五核苷酸重复基元和四核苷酸重复基元的SSR分别占14.2%和10.0%,没有发现六核苷酸重复基元的SSR.组成这些SSR的主要基序有AT/TA、CA/GT、GA/CT、CAG/GTC、AGG/TCC、TAA/AAT、GGC/CGG、GAC/CTG、CGA/GCT、GCA/CGT、GAG/CTC、ACC/CCA、TCTT、TTTG、TCCA、ATGAT/ATCAT、TCCCT、TTCCC.SSR的重复次数都在5以上,由此可以推测利用鹌鹑核苷酸序列和EST序列中的SSR序列将有可能开发一批有价值的SSR分子标记供各种研究所用.
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关 键 词: | 鹌鹑 微卫星 生物信息学方法 |
Microsatellite marker analysis of nucleotide acid sequences in quail |
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Abstract: | |
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Keywords: | |
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