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双齿围沙蚕CYP4基因的克隆及序列分析
引用本文:周一兵,陈雪,杨大佐,万良,王斌,王丽丽,孙静波.双齿围沙蚕CYP4基因的克隆及序列分析[J].大连水产学院学报,2011,26(6):507-513.
作者姓名:周一兵  陈雪  杨大佐  万良  王斌  王丽丽  孙静波
作者单位:1. 大连海洋大学辽宁省海洋生物资源恢复与生境修复重点实验室,辽宁大连,116023
2. 国家海洋环境监测中心,辽宁大连,116023
3. 宝生物工程(大连)有限公司,辽宁大连,116600
基金项目:国家"863"计划项目,国家海洋公益性行业科研专项,国家自然科学基金资助项目
摘    要:根据已知的绿沙蚕Nereisvirens细胞色素氧化酶CYP342A1保守区设计引物,采用RACE技术首次从双齿围沙蚕Perinereisaibuhitensis体壁肌肉中克隆出细胞色素氧化酶CYP4基因全长序列。分析结果表明,该序列全长为1857bp,5’端非翻译区为186bp,3’端非翻译区为225bp,阅读框为1446bp,编码为481个氨基酸。第422~431氨基酸序列符合P450所具有的结构保守共有序列FxxGxxxCxG,第319~322氨基酸序列为K螺旋特征基序ExxR区,第282~294氨基酸序列含有CYP4家族特征序列EVDTFMFEGHDTr。经Blast与GenBank中已知物种的氨基酸序列进行同源性比对,CYP4与多毛类绿沙蚕Nereisvirens CYP4BB1、CYP342A1(AY453408)氨基酸同源性为73%、36%,与多毛类小头虫CapiteUacapitataCYP4ATI(AY574044)同源性为39%。据此推断,双齿围沙蚕CYP4基因属于CYP4B亚家族。

关 键 词:双齿围沙蚕  CYP4  RACE  生物信息学分析

Cloning and sequence analysis of cytochrome CYP4 family in polychaete Perinereis aibuhitensis
ZHOU Yi-bing,CHEN Xue,YANG Da-zuo,WAN Liang,WANG Bin,WANG LI-li,SUN Jing-bo.Cloning and sequence analysis of cytochrome CYP4 family in polychaete Perinereis aibuhitensis[J].Journal of Dalian Fisheries University,2011,26(6):507-513.
Authors:ZHOU Yi-bing  CHEN Xue  YANG Da-zuo  WAN Liang  WANG Bin  WANG LI-li  SUN Jing-bo
Institution:1. Key Laboratory of Marine Bio-resources Restoration and Habitat Reparation in Liaoning Province, Dalian Ocean University, Dalian 116023 ,China; 2. National Marine Environmental Monitoring Center, Dalian 116023, China,3. Takara Biotechnology ( Dalian ) Co, LTD, Dalian 116600, China)
Abstract:
Keywords:Perinereis aibuhitensis  CYP4  RACE  sequence analysis
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