| 鸭坦布苏病毒E基因的分子特性分析 |
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| 引用本文： | 孙涛,王超,邓明俊,王群,郑小龙,徐彪.鸭坦布苏病毒E基因的分子特性分析[J].中国动物检疫,2015,32(12):59-65. |
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| 作者姓名： | 孙涛 王超 邓明俊 王群 郑小龙 徐彪 |
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| 摘 要： | 为给鸭坦布苏病毒（duck tembusu virus，DTMUV）囊膜糖蛋白选择良好的抗原域和宿主表达系统提供参考依据，本研究通过选取DTMUV QD株基因文库中的一个重组质粒并测序，结合NCBI的ORF Finder和BLAST工具发现一个全长为1488 bp完整开放阅读框架（Open Reading Frame，ORF）片段。将该ORF编码蛋白通过NCBI的BLASTP分析和DNAstar进化树分析，确定该蛋白与类黄病毒E基因编码的蛋白具有较高的相似性。随后应用生物信息学分析工具Conserved Domains确定保守结构域、运用SignalP4.1预测信号肽、TMHMM 2.0预测跨膜区。应用在线程序NetNGlyc1.0预测糖基化位点，NetPhos2.0预测磷酸化位点、ProtScale进行疏水性分析。最后运用在线EMBOSS和自动蛋白同源建模数据库进行3D结构预测以及密码子偏爱性分析。结果表明，E蛋白与其它黄病毒衣壳蛋白具有相似的功能，没有信号肽切割位点，在451-468和475-492aa区域含有跨膜区，为相对低表达基因，含有较多种类的稀有密码子，与人密码子使用频率较为接近。这为进一步研究DTMUV E基因的体外表达和宿主选择提供了分子生物学依据。
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| 关 键 词： | 鸭坦布苏病毒 生物学信息学 结构预测 |
The Molecular Property Analysis of Duck Tembusu Virus E Gene |
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| Sun Tao,Wang Chao,Deng Mingjun,Wang Qun,Zheng Xiaolong,Xu Biao.The Molecular Property Analysis of Duck Tembusu Virus E Gene[J].China Journal Of Animal Quarantine,2015,32(12):59-65. |
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| Authors: | Sun Tao Wang Chao Deng Mingjun Wang Qun Zheng Xiaolong Xu Biao |
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