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水稻与白叶枯病菌互作的基因表达谱分析与差异性表达基因的识别
引用本文:吴茂森,田峰,齐放军,何晨阳.水稻与白叶枯病菌互作的基因表达谱分析与差异性表达基因的识别[J].中国农业科学,2007,40(2):277-282.
作者姓名:吴茂森  田峰  齐放军  何晨阳
作者单位:中国农业科学院植物保护研究所/植物病虫害生物学国家重点实验室
基金项目:国家自然科学基金;中国农业科学院"杰出人才计划"项目
摘    要:【目的】从基因组水平上阐明水稻在与白叶枯病菌(Xanthomonas oryzae pv. oryzae,Xoo)感病互作条件下基因表达反应的特征。【方法】用cDNA-AFLP方法对Xoo接种处理不同时间的水稻细胞进行基因表达谱分析。【结果】在测定的大约4 000个水稻cDNA片段中,363个(9.1%)是差异性表达的,其中295个受Xoo诱导上调表达,68个被抑制下调表达。根据在不同互作时间点的表达特征,它们可分为7种表达类型。对31个差异片段的序列同源性进行分析,发现它们在己公布的水稻全基因组中完全相同的序列,但只有10个基因具有已知或推断的生物学功能,其余21个基因功能未知。用荧光实时定量PCR分析法证实了cDNA-AFLP基因表达结果。【结论】构建了水稻-Xoo感病组合在细胞水平上互作的基因表达谱,从基因组水平上识别了一批受Xoo诱导或抑制表达、与水稻感病反应相关的基因,这些新基因的发现为开展水稻感病功能基因组学的研究提供了材料。

关 键 词:水稻  白叶枯病菌  cDNA-AFLP  表达谱  差异性表达基因
收稿时间:2006-6-15
修稿时间:2006-06-15

cDNA-AFLP Analysis of Gene Expression Response to Xanthomonas oryzae pv. oryzae and Identification of Genes Expressed Differentially During this Compatible Interaction in Rice Suspension Cultured Cells
WU Mao-sen,TIAN Feng,QI Fang-jun,HE Chen-yang.cDNA-AFLP Analysis of Gene Expression Response to Xanthomonas oryzae pv. oryzae and Identification of Genes Expressed Differentially During this Compatible Interaction in Rice Suspension Cultured Cells[J].Scientia Agricultura Sinica,2007,40(2):277-282.
Authors:WU Mao-sen  TIAN Feng  QI Fang-jun  HE Chen-yang
Institution:State Key Laboratory for Biology of Plant Diseases and Insect Pests, Institute of Plant Protection, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing 100094
Abstract:
Keywords:cDNA-AFLP
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