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基于cpDNA条形码鉴定铁皮石斛种质资源
引用本文:付涛,胡仲义,何月秋,周亚美,毛阳正. 基于cpDNA条形码鉴定铁皮石斛种质资源[J]. 核农学报, 2017, 31(2). DOI: 10.11869/j.issn.100-8551.2017.02.0255
作者姓名:付涛  胡仲义  何月秋  周亚美  毛阳正
作者单位:宁波城市职业技术学院,浙江宁波,315502
摘    要:为选择适合鉴定铁皮石斛的条形码,以5份铁皮石斛种质资源和1份串珠石斛(外类群)为试验材料,采用cpDNA条形码技术进行分子鉴定。结果表明,5个条形码序列(matK、rbcL、trnH-psbA、petApsbJ和rpl32-trnL)种间遗传距离均远高于种内遗传距离,符合作为条形码的基本要求,其中petA-psbJ变异位点最多(8.03%),说明其进化速率亦最快,petA-psbJ可作为石斛属候选条形码之一;单个条形码鉴定率均较低(60%),核心条形码matK+rbcL鉴定率亦较低(68.75%),而在核心条形码基础上结合其它序列(≥3)却可以显著提高鉴定率(≥81.25%),matK+rbcL+petA-psbJ鉴定率达到100%,可作为铁皮石斛分子鉴定的最适条形码组合。综上,利用cpDNA条形码技术,可将不同种质资源的铁皮石斛区分开,基本上可将不同采集地的铁皮石斛聚类;同时,建议matK+rbcL+petA-psbJ作为铁皮石斛种质资源鉴定的DNA条形码。本研究结果为铁皮石斛种质资源的快速鉴定提供了一定的参考。

关 键 词:铁皮石斛  cpDNA  条形码  种质鉴定

Identification of Germplasm Resources in Dendrobium officinale Based on cpDNA Barcoding
FU Tao,HU Zhongyi,HE Yueqiu,ZHOU Yamei,MAO Yangzheng. Identification of Germplasm Resources in Dendrobium officinale Based on cpDNA Barcoding[J]. Acta Agriculturae Nucleatae Sinica, 2017, 31(2). DOI: 10.11869/j.issn.100-8551.2017.02.0255
Authors:FU Tao  HU Zhongyi  HE Yueqiu  ZHOU Yamei  MAO Yangzheng
Abstract:
Keywords:Dendrobium officinale  cpDNA  barcode  germplasm identification
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