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两种穗伸出差异显著的大麦最上节间全长转录组分析
引用本文:蒲茜,邱雪冰,张镌钰,汤燕燕,王金慧,李涛,杨钊,张海莉,梁俊俊,唐亚伟,邓光兵,龙海.两种穗伸出差异显著的大麦最上节间全长转录组分析[J].四川农业大学学报,2021,39(4):459-466.
作者姓名:蒲茜  邱雪冰  张镌钰  汤燕燕  王金慧  李涛  杨钊  张海莉  梁俊俊  唐亚伟  邓光兵  龙海
作者单位:中国科学院成都生物研究所,成都 610041;中国科学院大学,北京 101408;中国科学院成都生物研究所,成都 610041;西藏自治区农牧科学院,西藏自治区拉萨 850000
基金项目:中国科学院科技服务网络计划项目(STS);四川省科技支撑计划;国家科技重大专项;基础研究项目
摘    要:【目的】对两份穗伸出差异显著的大麦(Hordeum vulgare L.)材料的最上节间(UI)进行全长转录组分析,为揭示大麦UI伸长调控机制奠定基础。【方法】以包穗大麦材料CDB0012和穗伸出正常大麦品种XL19为材料,利用Nanopore平台开展了UI全长转录组测序和生物信息分析。【结果】共获得46 246条非冗余全长转录本,鉴定了2 395个潜在新基因位点和44 805条新转录本,开展了功能注释、可变剪切、差异表达基因鉴定等分析。【结论】构建了一套高质量大麦UI全长转录组数据集。

关 键 词:大麦  最上节间  全长转录组  可变剪接  长链非编码RNA
本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录!
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