| 怀地黄液泡质子泵焦磷酸水解酶基因的克隆与生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 周延清,张永华,陈艳梅,张喻,李静云,陈娟娟,白妍妍,魏海方.怀地黄液泡质子泵焦磷酸水解酶基因的克隆与生物信息学分析[J].河南农业科学,2013,42(3). |
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| 作者姓名： | 周延清 张永华 陈艳梅 张喻 李静云 陈娟娟 白妍妍 魏海方 |
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| 作者单位： | 河南师范大学生命科学学院,河南新乡,453007 |
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| 基金项目： | 河南省基础与前沿技术研究计划项目，河南省教育厅自然科学研究计划项目(科技攻关)，河南师范大学第三届大学生创新创业论坛暨大学生创新性实验计划项目 |
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| 摘 要： | 为了克隆地黄功能基因,根据NCBI GenBank核酸数据库中5种已知植物生长素诱导的器官膨大基因(ARGOS)碱基序列的保守区,利用CLUSTAL 2.1和DNAMAN 4.0软件设计简并引物,采用RT-PCR技术扩增出一个cDNA片段,测序表明,获得基因cDNA片段序列长度为495bp。经过NCBI数据库BLAST分析,发现它与莲花、蓖麻、烟草、苜蓿、葡萄、碧桃、灰绿藜7种植物的液泡膜质子泵焦磷酸水解酶基因同源性很高,在83%～86%,因此获得的基因是地黄液泡膜质子泵焦磷酸水解酶基因。
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| 关 键 词： | 怀地黄 液泡质子泵焦磷酸水解酶 基因克隆 cDNA末端快速扩增技术 生物信息学分析 |
Cloning and Bioinformatics Analysis of One Vacuolar H+-Pyrophosphatase Gene in Rehmannia glutinosa, f.hueichingensis (Chan et Sehih) Hsiao |
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| Abstract: | In this study,to clone Rehmannia glutinosa functional genes,a pair of degenerate pri-mers was designed using the software CLUSTAL 2.1 and DNAMAN 4.0 according to the conserved regions of the five known plant ARGOS base sequences from GenBank nucleic acid database in NCBI.One 495 bp-cDNA fragment of Rehmannia glutinosa.f.hueichingensis(Chan Et Sehih)Hsiao was cloned using RT-PCR.BLAST analysis indicated that its base sequence was homologous to those of seven known plant vacuolar H+-pyrophosphatase(V-PPase) genes from GenBank with an identity of 83%-86%,showing that it was V-PPase gene in Rehmannia glutinosa.f.hueichingensis(Chan Et Sehih)Hsiao. |
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| Keywords: | Rehmannia glutinosa f hueichingensis(Chan et Sehih)Hsiao vacuolar H+-pyrophosphatase(V-PPase) gene cloning RACE bioinformatics analysis |
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