| 猪主要经济性状的基因组选择研究 |
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| 引用本文： | 彭潇,尹立林,梅全顺,王海燕,刘小磊,朱猛进,李新云,付亮亮,赵书红.猪主要经济性状的基因组选择研究[J].畜牧兽医学报,2019(2):439-445. |
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| 作者姓名： | 彭潇 尹立林 梅全顺 王海燕 刘小磊 朱猛进 李新云 付亮亮 赵书红 |
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| 作者单位： | 华中农业大学农业动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室;生猪健康养殖协同创新中心 |
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| 基金项目： | 国家生猪产业技术体系项目(CARS-35);国家自然科学基金地区间国际重大合作项目(CGIAR31361140365);国家自然科学基金(31672391);华中农业大学大北农青年学者提升专项资助项目(2017DBN019) |
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| 摘 要： | 旨在系统比较GBLUP、SSGBLUP、BayesA、BayesB、BayesC、BayesLASSO、BSLMM和BayesR等8种方法对猪重要经济性状基因组选择的准确性。本研究以本实验室收集的2 585头大白猪达100kg日龄、达100kg背膘厚和母猪乳头数3个性状为分析对象,结合猪50K基因芯片分型数据,以加性模型为基础,利用5倍交叉验证比较8种方法的基因组选择准确性。研究发现,基因组选择的准确性与不同性状估计遗传力呈正相关。交叉验证结果表明,预测准确性最高的性状为达100kg日龄,但不同方法在不同性状中表现并不完全相同,在达100kg日龄和达100kg背膘厚中SSGBLUP基因组预测准确性均为最高,而在母猪乳头数中BayesA的基因组预测准确性最高。综上表明,对小样本开展基因组预测时,中、高等遗传力性状可以选择SSGBLUP方法,低等遗传力性状可以选择BayesA方法。如何优化和选择一种广泛适用于所有性状的方法,可能是未来研究的方向。
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| 关 键 词： | 猪 基因组选择 遗传力 准确性 |
A Study of Genome Selection Based on the Porcine Major Economic Traits |
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| PENG Xiao,YIN Lilin,MEI Quanshun,WANG Haiyan,LIU Xiaolei,ZHU Mengjin,LI Xinyun,FU Liangliang,ZHAO Shuhong.A Study of Genome Selection Based on the Porcine Major Economic Traits[J].Acta Veterinaria et Zootechnica Sinica,2019(2):439-445. |
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| Authors: | PENG Xiao YIN Lilin MEI Quanshun WANG Haiyan LIU Xiaolei ZHU Mengjin LI Xinyun FU Liangliang ZHAO Shuhong |
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| Institution: | (Key Laboratory of Agricultural Animal Genetics,Breeding and Reproduction of Ministry of Education,Huazhong Agricultural University,Wuhan 430070,China;The Cooperative Innovation Center for Sustainable Pig Production,Wuhan 430070,China) |
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| Abstract: | PENG Xiao;YIN Lilin;MEI Quanshun;WANG Haiyan;LIU Xiaolei;ZHU Mengjin;LI Xinyun;FU Liangliang;ZHAO Shuhong(Key Laboratory of Agricultural Animal Genetics,Breeding and Reproduction of Ministry of Education,Huazhong Agricultural University,Wuhan 430070,China;The Cooperative Innovation Center for Sustainable Pig Production,Wuhan 430070,China) |
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| Keywords: | pig genomic selection heritability accuracy |
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