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饲粮蛋白质源对断奶仔猪小肠全基因组转录谱的影响
引用本文:孙云子,余 冰,陈代文,陈希剑.饲粮蛋白质源对断奶仔猪小肠全基因组转录谱的影响[J].动物营养学报,2012(4):689-703.
作者姓名:孙云子  余 冰  陈代文  陈希剑
作者单位:四川农业大学动物营养研究所,雅安 625014;贵州师范大学生命科学学院,贵阳 550001;上海其明信息技术有限公司,上海 200234
基金项目:四川省教育厅重点项目(仔猪肠道功能基因表达与营养调控,230.2020);贵州省六盘水市科技局项目(52020)
摘    要:为探讨饲粮蛋白质源影响断奶仔猪小肠发育的分子机制,本试验利用猪全基因组表达谱芯片分析不同蛋白质源饲粮下断奶仔猪(断奶 0、3、7和 14d)小肠转录谱,24头仔公猪随机分为 2个处理,处理 1采用乳源蛋白质 30%替代饲粮总蛋白质,处理 2采用全植物蛋白质源饲粮。结果表明:1)处理 1获得 370个差异表达基因(P<0.05),采用序列试验聚类分析,共获得26个表达模式,其中有 3个显著表达模式,模式 5和 11显著性水平最高(P<0.01)。处理 2获得 263个差异表达基因(P<0.05),序列试验聚类分析得到 26个表达模式,其中模式 3和 22显著水平最高(P<0.01)。2)基因共表达网络构建和分析一定程度上揭示了不同蛋白质源饲粮对肠道发育的分子调控机制,以及两者之间的差异。通过基因芯片数据,从 2种蛋白质源饲粮处理下的基因调控网络中筛选出 12和 9个具有重要影响和研究价值的基因,以及 9个在 2个处理中网络调控地位发生改变的共表达基因。通过基因芯片数据,从 2种蛋白质源饲粮处理下的基因调控网络中筛选出 12和 9个具有重要影响和研究价值的基因,以及 9个在 2个处理中网络调控地位发生改变的共表达基因。总之,本试验筛选出了一些在不同饲粮蛋白质源影响断奶仔猪肠道发育和功能过程中可能具有深入研究意义的候选基因。

关 键 词:仔猪  基因芯片  基因调控网络  小肠  发育
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