| 草莓应答炭疽菌侵染的转录组分析 |
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| 引用本文： | 陈 哲,黄 静,赵 佳,梁 宏. 草莓应答炭疽菌侵染的转录组分析[J]. 植物保护, 2020, 46(3): 138-146 |
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| 作者姓名： | 陈 哲 黄 静 赵 佳 梁 宏 |
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| 作者单位： | 山西省农业科学院生物技术研究中心，太原 030031 |
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| 基金项目： | 山西省农业科学院特色农业技术攻关项目（YGG17067）；山西省应用基础研究项目（201601D202062） |
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| 摘 要： | 本研究以栽培草莓为材料,用炭疽菌对植株进行侵染,对健康草莓和患病草莓进行转录组分析(RNA-seq),共得到86 988个序列以及2 127个差异表达基因。利用GO数据库对差异表达基因进行了聚类分析,结果发现差异表达基因主要聚类在光合作用、氧化还原过程、氧化还原酶活性、碳固定过程以及糖代谢过程等方面。同时,利用KEGG数据库对差异表达基因影响的通路进行注释后发现,炭疽菌侵染主要影响了光合作用、倍半萜和三萜生物途径、类黄酮生物合成、谷胱甘肽代谢和植物激素信号转导等途径中关键基因的表达水平。挑选了20个差异表达基因进行qRT-PCR,结果有19个基因的表达趋势与转录测序结果一致。本研究获得的草莓应答炭疽菌侵染转录组数据信息,将有助于丰富草莓抗炭疽病的调控机制。
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| 关 键 词： | 草莓 炭疽菌 转录组分析 差异表达基因 |
| 收稿时间： | 2019-03-02 |
| 修稿时间： | 2019-05-11 |
Transcriptomics analysis of strawberry response to Colletotrichum theobromicola infection |
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| CHEN Zhe,HUANG Jing,ZHAO Ji,LIANG Hong. Transcriptomics analysis of strawberry response to Colletotrichum theobromicola infection[J]. Plant Protection, 2020, 46(3): 138-146 |
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| Authors: | CHEN Zhe HUANG Jing ZHAO Ji LIANG Hong |
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| Affiliation: | Biotechnology Research Center, Shanxi Academy of Agriculture Sciences, Taiyuan 030031, China |
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| Keywords: | |
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