| 甘薯G病毒吉林分离物的全基因组序列测定与分析 |
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| 引用本文： | 马俊丰,李小宇,张春雨,周雪平,王永志. 甘薯G病毒吉林分离物的全基因组序列测定与分析[J]. 植物保护, 2020, 46(3): 57-61 |
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| 作者姓名： | 马俊丰 李小宇 张春雨 周雪平 王永志 |
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| 作者单位： | 1. 吉林农业大学, 长春 130118; 2. 吉林省农业科学院, 公主岭 136100; 3. 中国农业科学院植物保护研究所, 北京 100193 |
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| 基金项目： | 国家重点研发计划（2017YFD0201604）;吉林省农业科技创新工程（CXGC2017JQ021）;吉林省农业产业技术体系马铃薯（甘薯）综合栽培技术示范与推广（2018） |
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| 摘 要： | 利用RT-PCR结合RACE方法,从感染SPVG的甘薯叶片中获得甘薯G病毒吉林分离物Jilin-gzl的全基因组序列。测序获得的Jilin-gzl分离物(GenBank No.Mk392509)基因组为10 797 nt。该病毒基因组含有一个10 464 nt的开放阅读框,编码由3 488个氨基酸构成的多聚蛋白。在P1和P3基因中也发现了由移码翻译产生的PISPO蛋白和PIPO蛋白。比对分析显示,在开放阅读框水平上Jilin-gzl与6个不同分离物核苷酸序列一致性为79%～99%,氨基酸一致性为92%～99%,其中与SC11、IS103、HG167和Jesus_Maria分离物一致性最高,与WT325和AI一致性最低。系统发育分析显示,Jilin-gzl与HG167和WCFR11系统发育关系最近,与中国台湾地区分离物WT325系统发育关系较远。这是中国大陆地区关于SPVG分离物全基因序列的首次报道,同时也是首次在中国东北地区发现SPVG。该研究探明了Jilin-gzl分离物的基因结构,系统发育关系,丰富了SPVG基因组序列信息,为后续开展SPVG种群的遗传进化及功能研究奠定了基础。
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| 关 键 词： | 甘薯G病毒(SPVG) 全基因组 比对分析 系统发育 |
| 收稿时间： | 2019-04-02 |
| 修稿时间： | 2019-06-01 |
Complete genome sequencing and analysis of Sweet potato virus G isolate from Jilin, China |
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| MA Junfeng,LI Xiaoyu,ZHANG Chunyu,ZHOU Xueping,WANG Yongzhi. Complete genome sequencing and analysis of Sweet potato virus G isolate from Jilin, China[J]. Plant Protection, 2020, 46(3): 57-61 |
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| Authors: | MA Junfeng LI Xiaoyu ZHANG Chunyu ZHOU Xueping WANG Yongzhi |
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| Affiliation: | 1. Jilin Agricultural University, Changchun 130118, China; 2. Jilin Academy of Agricultural Sciences, Gongzhuling 136100, China; 3. Institute of Plant Protection, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing 100193, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Sweet potato virus G (SPVG) complete genome comparative analysis phylogeny |
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