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山羊GH基因5'侧翼序列多态及生物信息学分析
引用本文:李中原,王锋,庞训胜,王芳,王子玉.山羊GH基因5'侧翼序列多态及生物信息学分析[J].中国农学通报,2007,23(6):42-46.
作者姓名:李中原  王锋  庞训胜  王芳  王子玉
作者单位:南京农业大学动物科技学院,南京,210095
基金项目:农业部农业结构调整重大技术研究专项"良种肉羊快速繁育关键技术研究与示范"(05-07-01B):农业部优势农产品重大技术示范推广项目"肉羊人工授精与舍饲快速育肥技术示范与推广"(2004-24).
摘    要:试验采用PCR-SSCP方法,分析了黄淮山羊、长江三角洲白山羊以及波尔山羊168只个体GH基因5'侧翼区两个位点的遗传多态性,同时分析了三个群体是否为平衡群体.结果如下在GH基因的两个位点上均发现了多态性,其中第1对引物出现6种基因型,存在2处突变;第2对引物出现3种基因型,存在3处突变.群体分析表明,第1个位点三个群体都处于非平衡状态,说明该位点有经过人工选择的可能;而第2个位点三个群体则都处于平衡状态.进一步利用生物信息学软件分析GH基因的5'侧翼序列,发现在其多态位点处存在IA-1、PIT-1、Gsh-2、C/EBP等多个分值较高的转录因子结合位点,其中264位T→C的突变导致PIT-1和Gsh-2结合位点的消失,至于这些位点是否会影响到GH基因的表达,进而影响到山羊个体的生长发育还需作进一步的研究.

关 键 词:PCR-SSCP  山羊  GH基因  多态性  生物信息学
修稿时间:2007年2月8日

Polymorphisms and Bioinformatics Analysis of the Goat Growth Hormone Gene in the 5'flanking Sequence
Li Zhongyuan,Wang Feng,Pang Xunsheng,Wang Ruifang,Wang Ziyu.Polymorphisms and Bioinformatics Analysis of the Goat Growth Hormone Gene in the 5'flanking Sequence[J].Chinese Agricultural Science Bulletin,2007,23(6):42-46.
Authors:Li Zhongyuan  Wang Feng  Pang Xunsheng  Wang Ruifang  Wang Ziyu
Abstract:
Keywords:
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