基于全长转录组测序的牛脂肪组织可变剪接事件分析

为探究可变剪接影响下更为复杂的脂肪沉积调控网络，明晰可变剪接事件的发生对脂肪沉积调控机制的影响，本研究基于PacBio测序平台的第三代测序技术，对夷陵黄牛腹腔脂肪、皮下脂肪、肌间脂肪进行全长转录组测序分析。共发现15 445个基因检测到50 520个可变剪接，占牛全部基因的33.4%。对这些基因进行富集分析发现，83个GO条目显著富集，这些显著富集的通路可能参与脂肪沉积网络的调控，其中16个与脂质合成及代谢相关，27条KEGG通路显著富集，其中15条与脂质合成及代谢相关。使用KOG、KEGG、NR、Swiss Prot、GO数据库对测序序列进行注释，80 756条序列共注释到69 259个基因，94 458条CDS序列及对应的pep序列。其中GO分析中15 039条序列富集到507个生物学过程条目，7 907条序列富集到214个细胞组分条目，30 672条序列富集到559个分子功能条目。KEGG数据分析富集到34条通路共49 710条序列，其中7 002条序列参与信号转导途径。以上结果表明，牛脂肪组织存在大量可变剪接事件，并且这些发生可变剪接事件的基因对脂肪沉积的调控发挥重要作用，这可...