| 鹅源新城疫病毒基因组密码子使用分析 |
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| 引用本文： | 曹永忠,顾敏,刘文博,刘秀梵. 鹅源新城疫病毒基因组密码子使用分析[J]. 中国家禽, 2009, 31(11) |
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| 作者姓名： | 曹永忠 顾敏 刘文博 刘秀梵 |
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| 作者单位： | 扬州大学农业部畜禽传染病学重点开放实验室,江苏,扬州,225009 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金重点项目，江苏省高枝自然科学基础研究计划面上项目，江苏省动物预防医学重点实验室开放课题 |
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| 摘 要： | 新城疫病毒(Newcastle Disease Virus,NDV)的跨种间传播机制是近年来研究的热点.选择NDV鹅源毒株ZJ1、SF02以及鸡源株、鸽源株和疫苗株La Sota株的全基因组序列,对其6个结构蛋白基因编码区序列运用SMS和CodonW软件进行了密码子使用分析,同时从物种密码子数据库获得鹅、鸡的密码子使用数据.与NDV基因组密码子使用情况进行比较.结果显示:鹅源、鸡源、鸽源与疫苗株NDV的基因组密码子使用情况基本一致;基因组密码子使用的偏向性较小,全基因组ENC值为57,6个编码基因的NEC值从54～60不等;基因组在密码子使用上存在28个优先使用的密码子,其中8个为高频使用密码子.鹅源NDV与鹅、鸡密码子使用偏性基本一致,仅5～6个密码子存在差异.
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| 关 键 词： | 新城疫病毒 密码使用 比较 |
Analysis of Codon Usage in Newcastle Disease Virus Strains Isolated from Goose |
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| CAO Yongzhong,GU Min,LIU Wenbo,LIU Xiufan. Analysis of Codon Usage in Newcastle Disease Virus Strains Isolated from Goose[J]. China Poultry, 2009, 31(11) |
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| Authors: | CAO Yongzhong GU Min LIU Wenbo LIU Xiufan |
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