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5个绵羊品种BMP6基因部分片段的多态及序列分析
引用本文:肖朝庭,狄冉,储明星,傅衍,方丽,马月辉,李奎,徐作鹏.5个绵羊品种BMP6基因部分片段的多态及序列分析[J].畜牧兽医学报,2008,39(12).
作者姓名:肖朝庭  狄冉  储明星  傅衍  方丽  马月辉  李奎  徐作鹏
作者单位:1. 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所,农业部畜禽遗传资源与利用重点开放实验室,北京,100193;浙江大学动物科学学院,杭州,310029
2. 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所,农业部畜禽遗传资源与利用重点开放实验室,北京,100193
3. 浙江大学动物科学学院,杭州,310029
4. 河北省平泉县农牧局,平泉,067500
基金项目:国家科技基础条件平台建设计划,国家重点基础研究发展规划(973计划),国家自然科学基金,北京市自然科学基金 
摘    要:根据GenBank发表的绵羊骨形态发生蛋白6(Bone morphogenetic protein6,BMP6)基因部分序列所包含的外显子5、6、7和小鼠BMP6基因外显子5、6、7序列设计3对引物,采用PCR-SSCP技术检测BMP6基因外显子5、6和7在小尾寒羊、湖羊、多赛特、特克塞尔、考力代5个绵羊品种301个个体中的单核苷酸多态性。结果发现这3对引物的扩增片段在检测的5个品种中均无多态性,说明所检测的BMP6外显子5、6、7序列比较保守。同时克隆了小尾寒羊(695bp)和济宁青山羊(699bp)部分BMP6mRNA以及小尾寒羊BMP6基因外显子3—4的内含子序列和两端部分外显子序列(785bp)。发现小尾寒羊和济宁青山羊的核苷酸和氨基酸序列差异很小,两者的核苷酸序列同源性高达99.28%,氨基酸序列同源性为98.1%,除济宁青山羊中插入一个丙氨酸外,两者只有4个氨基酸的差异。绵羊与牛、人、小鼠和大鼠的核苷酸同源性分别为97.04%、81.82%、84.68%和85.06%;氨基酸序列同源性分别为99.05%、91.43%、90.48%和92.38%,均大于90%,表明各物种BMP6核苷酸序列虽然差异较大,但氨基酸序列却非常保守。

关 键 词:绵羊  骨形态发生蛋白6基因  PCR-SSCP

Polymorphism and Sequence Analysis of Partial Fragment of BMP6 Gene in Five Sheep Breeds
XIAO Chao-ting,DI Ran,CHU Ming-xing,FU Yan,FANG Li,MA Yue-hui,LI Kui,XU Zuo-peng.Polymorphism and Sequence Analysis of Partial Fragment of BMP6 Gene in Five Sheep Breeds[J].Acta Veterinaria et Zootechnica Sinica,2008,39(12).
Authors:XIAO Chao-ting  DI Ran  CHU Ming-xing  FU Yan  FANG Li  MA Yue-hui  LI Kui  XU Zuo-peng
Institution:XIAO Chao-ting1,2,DI Ran1,CHU Ming-xing1*,FU Yan2,FANG Li1,MA Yue-hui1,LI Kui1,XU Zuo-peng3(1.Key Laboratory of Farm Animal Genetic Resources , Utilization of Ministry of Agriculture,Institute of Animal Science,Chinese Academy of Agricultural Sciences,Beijing 100193,China,2.College of Animal Science,Zhejiang University,Hangzhou 310029,3.Agriculture , Animal Husb,ry Bureau of Pingquan County,Hebei Province,Pingquan 067500,China)
Abstract:Single nucleotide polymorphisms(SNPs) of exons 5,6,7 of bone morphogenetic protein 6(BMP6) gene were detected in 301 individuals of five sheep breeds(Small-tailed Han,Hu,Dorset,Texel and Corriedale sheep) with three pairs of primers by polymerase chain reaction(PCR)-single strand conformation polymorphism(SSCP).No polymorphisms were detected in the amplified regions of three pairs of primers in five sheep breeds tested,which may indicate that the sequences of exons 5,6,7 of BMP6 gene were rather conserved.O...
Keywords:PCR-SSCP
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