侵染东方百合的黄瓜花叶病毒两个分离物cp 基因克隆和进化分析 |
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引用本文: | 刘文洪,洪健,陈集双,叶美琴.侵染东方百合的黄瓜花叶病毒两个分离物cp 基因克隆和进化分析[J].农业生物技术学报,2004,12(4):442-445. |
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作者姓名: | 刘文洪 洪健 陈集双 叶美琴 |
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作者单位: | 1. 浙江大学生命科学学院;浙江大学分析测试中心,杭州,310029 2. 浙江大学分析测试中心,杭州,310029 3. 浙江大学生命科学学院 4. 浙江丽水市农业局,丽水,323000 |
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基金项目: | 国家高技术研究与发展计划(863)项目(No.2002AA1121)和国家科技部农业科技成果转化专项(No.02EFN213300269). |
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摘 要: | 从浙江丽水和杭州的东方百合(Lilium cv.Oriental hybrids)上得到2个黄瓜花叶病毒分离物CMV-LS和CMV-HZ,采用RT-PCR法分别扩增得到2条长约1000nt片段,经序列测定,全长分别为996nt和998nt,两分离物的外壳蛋白(cp)基因由657nt组成。将两分离物的cp基因与其它24个CMV分离物进行了同源性比较,在cp基因核苷酸水平上,CMV-LS与亚组Ⅰ和亚组Ⅱ的同源性分别为90.6%~99.7%和68.6%~77%,CMV-HZ与亚组Ⅰ和亚组Ⅱ的同源性分别为90.7%~98.8%和68.6%-77%。在氨基酸水平上,CMV-LS与亚组Ⅰ和亚组Ⅱ的同源性分别为94.5%-99.1%和65.7%-78.5%,CMV-HZ与亚组Ⅰ和亚组Ⅱ的同源性分别为94.1%-98.6%和66.4%-78.1%。表明两分离物均属于CMV亚组Ⅰ成员。cp基因序列系统进化树分析表明,来自百合的CMV分离物在系统进化树中单独成簇,不受地域差异的影响,出现了寄主适应性变异,形成明显的株系分化趋势。
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关 键 词: | 黄瓜花叶病毒 东方百合 分离物 进化分析 基因克隆 RT-PCR法 系统进化树 侵染 cp基因 同源性比较 寄主适应性 亚组Ⅱ CMV 浙江丽水 序列测定 外壳蛋白 基因序列 地域差异 株系分化 核苷酸 氨基酸 分析表 水平 全长 |
修稿时间: | 2003年8月23日 |
Cloning and Phylogenetic Analysis of cp Gene for Two CMV Isolates Infecting Lilium cv.Oriental Hybrids |
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Abstract: | |
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