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侵染东方百合的黄瓜花叶病毒两个分离物cp 基因克隆和进化分析
引用本文:刘文洪,洪健,陈集双,叶美琴.侵染东方百合的黄瓜花叶病毒两个分离物cp 基因克隆和进化分析[J].农业生物技术学报,2004,12(4):442-445.
作者姓名:刘文洪  洪健  陈集双  叶美琴
作者单位:1. 浙江大学生命科学学院;浙江大学分析测试中心,杭州,310029
2. 浙江大学分析测试中心,杭州,310029
3. 浙江大学生命科学学院
4. 浙江丽水市农业局,丽水,323000
基金项目:国家高技术研究与发展计划(863)项目(No.2002AA1121)和国家科技部农业科技成果转化专项(No.02EFN213300269).
摘    要:从浙江丽水和杭州的东方百合(Lilium cv.Oriental hybrids)上得到2个黄瓜花叶病毒分离物CMV-LS和CMV-HZ,采用RT-PCR法分别扩增得到2条长约1000nt片段,经序列测定,全长分别为996nt和998nt,两分离物的外壳蛋白(cp)基因由657nt组成。将两分离物的cp基因与其它24个CMV分离物进行了同源性比较,在cp基因核苷酸水平上,CMV-LS与亚组Ⅰ和亚组Ⅱ的同源性分别为90.6%~99.7%和68.6%~77%,CMV-HZ与亚组Ⅰ和亚组Ⅱ的同源性分别为90.7%~98.8%和68.6%-77%。在氨基酸水平上,CMV-LS与亚组Ⅰ和亚组Ⅱ的同源性分别为94.5%-99.1%和65.7%-78.5%,CMV-HZ与亚组Ⅰ和亚组Ⅱ的同源性分别为94.1%-98.6%和66.4%-78.1%。表明两分离物均属于CMV亚组Ⅰ成员。cp基因序列系统进化树分析表明,来自百合的CMV分离物在系统进化树中单独成簇,不受地域差异的影响,出现了寄主适应性变异,形成明显的株系分化趋势。

关 键 词:黄瓜花叶病毒  东方百合  分离物  进化分析  基因克隆  RT-PCR法  系统进化树  侵染  cp基因  同源性比较  寄主适应性  亚组Ⅱ  CMV  浙江丽水  序列测定  外壳蛋白  基因序列  地域差异  株系分化  核苷酸  氨基酸  分析表  水平  全长
修稿时间:2003年8月23日

Cloning and Phylogenetic Analysis of cp Gene for Two CMV Isolates Infecting Lilium cv.Oriental Hybrids
Abstract:
Keywords:
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