大麻SSR标记的开发及指纹图谱的构建 |
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引用本文: | 信朋飞,臧巩固,赵立宁,高春生,程超华,唐蜻.大麻SSR标记的开发及指纹图谱的构建[J].中国麻业,2014(4):174-182. |
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作者姓名: | 信朋飞 臧巩固 赵立宁 高春生 程超华 唐蜻 |
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作者单位: | 中国农业科学院麻类研究所,湖南长沙410205 |
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基金项目: | 国家麻类产业技术体系分子育种(CARS-19-E04)、国际科技合作与交流专项(2010DFR30620-4) |
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摘 要: | 表达序列标签(expressed sequence tags,EST)是开发SSR标记的重要资源.本研究从NCBI中大麻EST数据库中检索到1114个SSR,分布于989条EST序列中,占EST总数的7.66%.其中三、六核苷酸重复基元类型居多,分别占EST-SSR总数的39.84%和34.56%,统计得到三核苷酸重复类型47种,六核苷酸重复类型113种.利用部分EST-SSR序列设计49对SSR引物,其中40对引物有扩增产物,占所设计引物总数的81.63%.进一步用这些引物在24个大麻品种进行多态性检测,29对引物显示多态性,占可扩增引物的72.5%.利用E-7、E-8、E-11、E-18、E-21、E-39及E-48共7对引物构建了24份供试材料的SSR指纹图谱.本研究结果证明了基于大麻EST信息建立SSR标记是一种有效而又可行的方法,并且为这些品种的真伪鉴定和保护提供科学依据.
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关 键 词: | 大麻 SSR 指纹图谱 |
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