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鹅和番鸭细小病毒全基因克隆与序列分析
引用本文:张云,耿宏伟,郭东春,胡奇林,相文华,刘明,杨涛,林巍.鹅和番鸭细小病毒全基因克隆与序列分析[J].中国预防兽医学报,2008,30(6):415-419.
作者姓名:张云  耿宏伟  郭东春  胡奇林  相文华  刘明  杨涛  林巍
作者单位:1. 中国农业科学院哈尔滨兽医研究所兽医生物技术国家重点实验室禽病室,黑龙江,哈尔滨,150001
2. 中国农业科学院哈尔滨兽医研究所大动物病研究室,黑龙江,哈尔滨,150001
3. 中国农业科学院哈尔滨兽医研究所动物流感参考实验室,黑龙江,哈尔滨,150001
基金项目:国家重点基础研究发展计划(973计划)
摘    要:本研究采用PCR技术扩增了鹅和番鸭全长细小病毒基因;其中鹅和番鸭细小病毒非结构蛋白基因(NS)全长为1884bp,编码627个氨基酸;结构基因(VP)全长为2199bp,编码732个氨基酸;序列分析表明:鹅和番鸭细小病毒NS之间的核苷酸和氨基酸同源性分别为80.9%~82.9%和89.5%~91.2%,而相应的鹅细小病毒之间的同源性为93.7%~99.8%和96.8%~99.7%,番鸭细小病毒之间的同源性为98.8%~99.8%和98.6%~99.5%;在核苷酸和氨基酸水平上,鹅和番鸭细小病毒VPI之间的同源性分别为79.7%~88.7%和85.5%~93.3%,而相应的鹅细小病毒之间的同源性为88.8%~99.6%和91.5%~99.2%,番鸭细小病毒之间的同源性为98.1%~99.6%和97.1%~98.8%;番鸭和鹅细小病毒NS和vp1基因的系统进化树分析表明:番鸭和鹅呼细小病毒来自共同的祖先,但随着宿主的不同而演化为不同的分支。

关 键 词:鹅细小病毒  番鸭细小病毒  NS基因  vp1基因  序列分析  番鸭  病毒  全基因  克隆与序列分析  genome  length  full  analysis  分支  演化  宿主  祖先  系统进化树  水平  同源性  核苷酸  分析表  结构基因  氨基酸  编码
文章编号:1008-0589(2008)06-0415-05
修稿时间:2007年12月18

Sequence analysis of the full length genome of waterfowl parvovirus
ZHANG Yun,GENG Hong-wei,GUO Dong-chun,HU Qi-lin,XIANG Wen-hua,LIU Ming,YANG Tao,LIN Wei.Sequence analysis of the full length genome of waterfowl parvovirus[J].Chinese Journal of Preventive Veterinary Medicine,2008,30(6):415-419.
Authors:ZHANG Yun  GENG Hong-wei  GUO Dong-chun  HU Qi-lin  XIANG Wen-hua  LIU Ming  YANG Tao  LIN Wei
Abstract:
Keywords:
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