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烟草糖苷水解酶GH3基因家族鉴定与表达分析
引用本文:张贞宇,罗正飞,杨帅,顾江南,尹协,韦银龙,聂琼.烟草糖苷水解酶GH3基因家族鉴定与表达分析[J].山东农业科学,2024(4):9-19.
作者姓名:张贞宇  罗正飞  杨帅  顾江南  尹协  韦银龙  聂琼
作者单位:1. 贵州大学烟草学院/贵州省烟草品质研究重点实验室;2. 贵州大学农学院
摘    要:糖苷水解酶GH3基因家族在植物的糖代谢和生长发育中起着重要作用,而烟草GH3基因家族目前尚未见相关鉴定和分析研究报道。本研究采用生物信息学方法在烟草基因组中鉴定GH3家族基因,并对其在不同组织中及逆境条件下的表达模式进行了分析。结果表明,在普通烟草K326的基因组中共鉴定出35个GH3基因,其中23个被定位在14条染色体上,存在6对共线性基因;GH3家族蛋白均为热稳定性蛋白,其基因上游启动子区均包含多个激素和胁迫响应元件。转录组数据表明,GH3家族基因大多数在烟苗茎尖高表达,少部分在根和茎中高表达,表达量受光照时间影响;烟苗受到干旱胁迫后GH3家族成员都有不同程度的响应。挑选4个NtGH3基因进行qRT-PCR分析,结果表明, NtGH3-5、NtGH3-19、NtGH3-22、NtGH3-26可能参与响应低温以及ABA处理。这可为深入了解烟草GH3基因家族及其功能提供依据。

关 键 词:烟草  GH3基因家族  糖苷水解酶  生物信息学分析  表达模式
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