全基因组关联分析定位水稻分蘖角度QTL

【目的】水稻分蘖角度是影响水稻产量的关键农艺性状，挖掘水稻分蘖角度QTL（基因）及其优势单倍型，有助于构建水稻理想株型。【方法】以333份来自水稻3K资源的核心种质为研究材料，于2020年和2022年分别在湖南农业大学耘园基地和春华基地种植，在抽穗期测量分蘖角度，结合基因型，利用TASSEL 5.2的MLM模型进行全基因组关联分析。【结果】共检测到6个分蘖角度QTL位点，分布在水稻2、5、6、9和12号染色体上，分别命名为qTA2、qTA5、qTA6.1、qTA6.2、qTA9和q TA12，这些QTL的表型贡献率为6.23%～16.22%。除了qTA9与分蘖角度主效QTLTAC1共定位外，其余5个QTL均为新的位点。进一步对5个QTL位点进行候选基因分析，初步筛选到qTA2和qTA6.1的候选基因别为Os02g0817900和Os06g0682800，候选基因Os02g0817900编码水稻细胞色素P450家族蛋白，候选基因Os06g0682800编码锌指结构域蛋白。【结论】本研究挖掘到新的水稻分蘖角度相关位点并对候选基因进行了分析，为分蘖角度新QTL（基因）的克隆以及分蘖角度的遗传...