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海蜇(Rhopilema esculentum)磷脂酶A2基因的cDNA、基因组克隆与表达分析
引用本文:杨 洪,朱 玲,骆晓蕊,周春娅,庄志猛. 海蜇(Rhopilema esculentum)磷脂酶A2基因的cDNA、基因组克隆与表达分析[J]. 渔业科学进展, 2016, 37(6): 123-130. DOI: 10.11758/yykxjz.20150521002
作者姓名:杨 洪  朱 玲  骆晓蕊  周春娅  庄志猛
作者单位:1. 中国水产科学研究院黄海水产研究所 青岛 266071;上海海洋大学水产与生命学院 上海201306;2. 中国水产科学研究院黄海水产研究所 青岛 266071;青岛海洋科学与技术国家实验室海洋生物学与生物技术功能实验室 青岛 266071
基金项目:国家自然科学基金(31372507)、国家重点基础研究发展计划(973)项目(2011CB403605)和上海海洋大学研究生科研基金(A1-0209-14-0900-57)共同资助
摘    要:本研究利用RACE和RT-PCR技术克隆了海蜇(Rhopilema esculentum)磷脂酶A2基因(Re-PLA2-1)的cDNA及基因组序列,并分析了其mRNA在海蜇不同发育阶段的表达.Re-PLA2-1基因的cDNA全长为824 bp,包括了48 bp的5'非编码区、504 bp的开放阅读框及272 bp的3'非翻译区.SMART分析显示,Re-PLA2-1为分泌蛋白,包括了一个由19个氨基酸组成的信号肽和一个由118个氨基酸组成的磷脂酶A2结构域.多序列比对和系统进化分析显示,Re-PLA2-1基因与来自星状海葵(Nematostella vectensis)、僧袍芋螺(Conus magus)、长牡蛎(Crassostrea gigas)等磷脂酶A2的相似性较高,共同聚类为pfam09056 GIX PLA2分支,均包含pfam09056家族成员酶活性所必需的Ca2+结合位点、活性催化位点和PLA2结构域所必需形成二硫键的半胱氨酸.Re-PLA2-1基因组全长为2671 bp,由4个外显子和3个内含子组成.RT-PCR结果显示,Re-PLA2-1基因在海蜇4个发育阶段均有表达,其中,横裂体阶段的表达量最高,碟状体阶段最低.这些研究结果为进一步了解海蜇磷脂酶A2毒素的生物功能奠定了基础.

关 键 词:海蜇  磷脂酶A2  cDNA  基因组  表达分析
收稿时间:2015-05-21
修稿时间:2016-03-02

cDNA, Genome Cloning, and mRNA Expression of Phospholipase A2 Gene from the Rhopilema Esculentum
YANG Hong,ZHU Ling,LUO Xiaorui,ZHOU Chunya and ZHUANG Zhimeng. cDNA, Genome Cloning, and mRNA Expression of Phospholipase A2 Gene from the Rhopilema Esculentum[J]. Progress in Fishery Sciences, 2016, 37(6): 123-130. DOI: 10.11758/yykxjz.20150521002
Authors:YANG Hong  ZHU Ling  LUO Xiaorui  ZHOU Chunya  ZHUANG Zhimeng
Affiliation:Yellow Sea Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences, Qingdao 266071; College of Fisheries and Life Science, Shanghai Ocean University, Shanghai 201306,Yellow Sea Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences, Qingdao 266071;Marine Biology and Biotechnology Laboratory, Qingdao National Laboratory for Marine Science and Technology, Qingdao 266071,Yellow Sea Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences, Qingdao 266071; College of Fisheries and Life Science, Shanghai Ocean University, Shanghai 201306,Yellow Sea Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences, Qingdao 266071;Marine Biology and Biotechnology Laboratory, Qingdao National Laboratory for Marine Science and Technology, Qingdao 266071 and Yellow Sea Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences, Qingdao 266071;Marine Biology and Biotechnology Laboratory, Qingdao National Laboratory for Marine Science and Technology, Qingdao 266071
Abstract:
Keywords:Rhopilema esculentum   Phospholipases A2   cDNA   Genome   Expression analysis
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