|
|||||
|
|
| 三角鲂肝脏EST序列微卫星信息分析 | |
| 作者单位： | ;1.杭州市农业科学研究院 |
| 摘 要： | 利用RNA-Seq技术对三角鲂的肝脏进行了转录组测序,获得了大量EST序列后,利用MISA软件进行微卫星信息分析。结果表明,通过转录组测序获得三角鲂EST序列62780条,长度31.9 Mb,发现8853个SSR,出现频率为14.1%。在三角鲂EST-SSR中,重复单元以1~2碱基重复为最多,并以长度小于16 bp的短重复序列为主,间隔SSR和复合SSR的EST序列RPKM均值低于单纯型SSR的EST序列RPKM均值,且在单纯型SSR中SSR长度越长,其RPKM均值则越低。因此,对富含SSR位点的EST序列的挖掘将为开发SSR特异性标记,并应用于三角鲂生物多样性和选育提供了参考。 |
| 关 键 词： | 三角鲂 表达序列标签 微卫星 序列分析 |
Analysis of Microsatellite Information of Expressed Sequence Tags in Liver of Megalobrama terminalis |
|
| Abstract: | |
| Keywords: | |
| 本文献已被 CNKI 等数据库收录！ | |