牡丹反转录转座子RT基因的分离与序列分析 |
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引用本文: | 贾甜甜,郭大龙,侯小改,刘改秀,王丽娜,张修铭,李双双.牡丹反转录转座子RT基因的分离与序列分析[J].华北农学报,2012(6):30-33. |
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作者姓名: | 贾甜甜 郭大龙 侯小改 刘改秀 王丽娜 张修铭 李双双 |
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作者单位: | 河南科技大学农学院;河南科技大学林学院;中国洛阳国家牡丹基因库 |
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基金项目: | 河南省高校科技创新人才支持计划项目(2010HASTTT002);国家自然科学基金(31070620);河南省高等学校青年骨干教师项目(2010GGJS-072);河南科技大学大学生研究训练计划(2011270) |
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摘 要: | 以牡丹基因组为模板,利用简并引物进行PCR扩增,得到了编码Ty1-copia类反转录转座子反转录酶(RT基因)的序列,测序后所得序列长度为240 bp,包含2个开放读码框,共编码63个氨基酸。经NCBI中BLAST比对结果显示,洛阳红牡丹RT基因与枸杞、甜菜等RT基因的同源性均在70%以上。经MEGA和DNAstar软件分析表明,该片段在进化上与梅、杨、茶和苹果等落叶木本植物的同源性序列存在更高的同源性和更近的亲缘关系,与枸杞、鹰嘴豆、番茄、草莓等草本植物的同源性序列亲缘性较远。
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关 键 词: | 牡丹 反转录转座子 RT基因 克隆 |
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