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动态性状候选基因检测效率分析
引用本文:罗晶,张宏,杨润清.动态性状候选基因检测效率分析[J].上海交通大学学报(农业科学版),2004,22(4):327-333.
作者姓名:罗晶  张宏  杨润清
作者单位:1. 东北农业大学,动物科学技术学院,哈尔滨,150030
2. 哈尔滨理工大学,计算机与控制学院,哈尔滨,150040
3. 上海交通大学,农业与生物学院,上海,201101
基金项目:上海交通大学博士基金资助(A2737A)
摘    要:把组 织 器官 的生 长 发育 和随 生 命时 期 或某 些定 量因 素 变化 的 生产 性能 统 称为 动 态性 状。 本 研究 的目 的 是将 动 态性状基 因定 位分 析 的普 适 性方 法应 用 到动 态性 状 候选 基因 分 析中 。采 用 M onte C arlo 法 模拟 分析 抽 样个 体数 、测 定 日频 率、候选基因 频率 和遗 传 贡献 率 等因 素对 动 态性 状候 选 基因 检测 统 计效 率的 影 响。模 拟 试验 结 果表 明:4因素 对候 选 基因 检测 效 率的影响 存在 着差 异 ,它 们 的作 用大 小顺 序 为:累计 遗 传贡 献率 > 个体 数> 测 定日 频数 > 基因 频率 ;个体 数和 测定 日 频数 2因素对候 选基 因检 测 效率 表 现出 一定 的 交互 作用 。

关 键 词:动态性状  候选基因  检测效率  累计遗传贡献率  个体数  测定日频数  基因频率
文章编号:1671-9964(2004)04-0327-07
修稿时间:2004年2月27日

Analysis for Detecting Power of Dynamic Trait Candidate Gene
LUO Jing,ZHANG Hong,YANG Run-qing.Analysis for Detecting Power of Dynamic Trait Candidate Gene[J].Journal of Shanghai Jiaotong University (Agricultural Science),2004,22(4):327-333.
Authors:LUO Jing  ZHANG Hong  YANG Run-qing
Institution:LUO Jing 1,ZHANG Hong 2,YANG Run-qing 3
Abstract:Both growth development of issues an d organs and performance changing wi th time of life or certain quantitative factors belong to the category of dynamic tra it,which are major interest of developmental genetics and plant and anim al breeding studies.The objectives of this study are to apply the mathematical model for dynamic t rait linkage mapping analysis in sta tistical analysis of their candidate genes and to investigate e ffect of various factors,such as gen e frequency,sample size,test day fr equency and accumulative genetic contribution ratio,on dete cting power of dynamic trait candidate genes by using Monte Carlo simulations.The results indicated that there were some differences in t he power of detecting candidate gene among the four affecting factors.The order of effects of four factors on the power of detecting can didate gene is accumulative genetic contribution ratio >number of indiv iduals>test day fre-quency>gene frequency.There was di stinct interaction between number o f individuals and test day frequency.
Keywords:dynamic trait  candidate gene  detecting power  factor analysis
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