| 根瘤菌基因组内简单重复序列的分析 |
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| 引用本文： | 高亚梅,韩毅强,汤辉,孙东梅,王彦杰,王伟东.根瘤菌基因组内简单重复序列的分析[J].中国农业科学,2008,41(10):2992-2998. |
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| 作者姓名： | 高亚梅 韩毅强 汤辉 孙东梅 王彦杰 王伟东 |
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| 作者单位： | 黑龙江八一农垦大学生命科学技术学院 |
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| 基金项目： | 黑龙江农垦总局科技局攻关项目，黑龙江八一农垦大学校引进人才基金 |
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| 摘 要： | 【目的】分析根瘤菌基因组中的简单重复序列（simple sequence repeats，SSRs），为其在根瘤菌遗传多样性研究中的应用提供有益的信息。【方法】利用公共的微生物串联重复序列数据库资源，对已测序的3种根瘤菌基因组中SSRs的结构类型、分布、丰度等进行系统的比较分析。【结果】大豆慢生根瘤菌（Bradyrhizobium japonicum）、百脉根根瘤菌（Mesorhizobium loti）和苜蓿中华根瘤菌（Sinorhizobium meliloti）基因组中的SSRs分别为1 410个、859个和638个，3种根瘤菌基因组中长重复的四、五、六核苷酸基序更为丰富，变异性更高。数目最少的为单碱基重复。【结论】3种根瘤菌的SSR在结构类型和分布规律上均具有一定的相似性。
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| 关 键 词： | 根瘤菌 基因组 微卫星序列 |
| 收稿时间： | 2007-9-16 |
Analysis of Simple Sequence Repeats in Rhizobium Genomes |
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| GAO Ya-mei,HAN Yi-qiang,TANG Hui,SUN Dong-mei,WANG Yan-jie,WANG Wei-dong.Analysis of Simple Sequence Repeats in Rhizobium Genomes[J].Scientia Agricultura Sinica,2008,41(10):2992-2998. |
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| Authors: | GAO Ya-mei HAN Yi-qiang TANG Hui SUN Dong-mei WANG Yan-jie WANG Wei-dong |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Rhizobium Genome Simple sequence repeats |
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