| 人工神经网络在作物基因组选择中的应用 |
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| 引用本文： | 束永俊,吴磊,王丹,郭长虹.人工神经网络在作物基因组选择中的应用[J].作物学报,2011,37(12):2179-2186. |
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| 作者姓名： | 束永俊 吴磊 王丹 郭长虹 |
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| 作者单位： | 哈尔滨师范大学生命科学与技术学院 / 黑龙江省分子细胞遗传与遗传育种重点实验室, 黑龙江哈尔滨 150025 |
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| 基金项目： | 哈尔滨师范大学青年骨干教师基金，哈尔滨师范大学科技创新团队，国际科技合作项目，国家重点基础研究计划(973计划)前期项目，黑龙江省科技攻关项目 |
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| 摘 要： | 目前, 基因组选择育种主要采用线性模型估计遗传育种值指导作物遗传育种的筛选过程, 但是生物体内的基因以及遗传位点的关系主要是复杂的非线性调控。本研究将人工神经网络技术应用到作物基因组选择育种中, 对现有的作物基因组选择育种模型进行优化, 建立了高效的作物基因组选择预测系统, 并与其他线性回归预测模型进行比较。通过分析小麦的育种数据发现, 基于人工神经网络的遗传育种估计效果优于其他线性回归预测模型, 预测育种值与实际育种值间的相关系数平均值达到0.6636, 相应的岭回归BLUP、贝叶斯线性回归模型和基于系谱信息的贝叶斯回归模型的预测能力分别为0.6422、0.6294和0.6573; 最优的预测效果达到0.8379, 远高于其他2种模型的最优结果。同时, 基于人工神经网络的基因组选择模型的预测效果稳定, 与传统的统计模型相近, 因此, 利用人工神经网络技术建立基因组选择是可行的。
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| 关 键 词： | 基因组选择 小麦 人工神经网络 岭回归BLUP}贝叶斯线性回归 |
| 收稿时间： | 2011-05-30 |
Application of Artificial Neural Network in Genomic Selection for Crop Improvement |
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| SHU Yong-Jun,WU Lei,WANG Dan,GUO Chang-Hong.Application of Artificial Neural Network in Genomic Selection for Crop Improvement[J].Acta Agronomica Sinica,2011,37(12):2179-2186. |
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| Authors: | SHU Yong-Jun WU Lei WANG Dan GUO Chang-Hong |
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| Institution: | Key Laboratory of Molecular Cytogenetics and Genetic Breeding of Heilongjiang Province / College of Life Science and Technology, Harbin Normal University, Harbin 150025, China |
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| Abstract: | With important progress in marker technologies,marker-assisted selection(MAS) has been used broadly for the crop improvement.Biparental populations are designed for the detection of quantitative trait loci(QTLs),but their application is re-tarded.The association mapping(AM) is applied directly to natural populations,which has been proposed to mitigate the lack of relevance of biparental populations in QTL identification.Many QTLs are identified by the two methods,which have encouraged genetic improvement of... |
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| Keywords: | Genomic selection Wheat Artificial neural network Ridge regression BLUP Bayesian linear regression |
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