| 果子狸源呼肠孤病毒MPC/04株全基因组序列测定与分析 |
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| 引用本文： | 邵昱昊,韩宗玺,李慧昕,孔宪刚,刘胜旺.果子狸源呼肠孤病毒MPC/04株全基因组序列测定与分析[J].中国预防兽医学报,2010,32(8). |
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| 作者姓名： | 邵昱昊 韩宗玺 李慧昕 孔宪刚 刘胜旺 |
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| 作者单位： | 中国农业科学院哈尔滨兽医研究所,兽医生物技术国家重点实验室/禽传染病研究室,黑龙江,哈尔滨,150001 |
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| 基金项目： | 国家重点基础研究发展计划("973"计划) |
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| 摘 要： | 为获得果子狸源呼肠孤病毒(MRV)Masked Palm Civet/China/Liu/2004(MPC/04)株的全基因序列,本研究根据GenBank中登录的哺乳动物MRV基因序列设计了22对引物,运用RT-PCR技术对该毒株的各个基因片段进行了扩增和同源性分析,并绘制系统发育进化树。结果显示该毒株L1、L2、M1和S3基因核苷酸序列与SARS病人体内分离到的SARS病毒T2/BYD1/human/Song/2006(T2S)株同源性较高,该病毒株L3、M2、M3、S1、S2和S4基因核苷酸序列与病猪体内分离到的MRV株SC-A/pig/Zeng/2006(SC-A)同源性较高,系统发育进化树同样表明各个病毒株的不同基因节段均具有不同的进化过程,推测MRV不同病毒株之间存在重配现象。通过MPC/04株S1基因同源性分析和核苷酸系统发育进化树分析,表明该病毒株S1基因与MRV血清3型的S1基因同源性较高,而与其它血清型的同源性较低,因此初步判断该病毒株血清型为血清3型。
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| 关 键 词： | 呼肠孤病毒 基因组 序列分析 |
Whole genome sequencing of Mammalian orthoreovirus MPC/04 strain from Masked Civet Cats |
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| SHAO Yu-hao,HAN Zong-xi,LI Hui-xin,KONG Xian-gang,LIU Sheng-wang.Whole genome sequencing of Mammalian orthoreovirus MPC/04 strain from Masked Civet Cats[J].Chinese Journal of Preventive Veterinary Medicine,2010,32(8). |
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| Authors: | SHAO Yu-hao HAN Zong-xi LI Hui-xin KONG Xian-gang LIU Sheng-wang |
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