毛白杨α-微管蛋白基因家族的克隆与序列分析 |
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引用本文: | 饶国栋,睢金凯,张建国.毛白杨α-微管蛋白基因家族的克隆与序列分析[J].林业科学研究,2015,28(1):44-49. |
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作者姓名: | 饶国栋 睢金凯 张建国 |
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作者单位: | 国家林业局林木培育重点实验室, 中国林业科学研究院林业研究所, 北京 100091;南京林业大学南方现代林业协同创新中心, 江苏 南京 210037;国家林业局林木培育重点实验室, 中国林业科学研究院林业研究所, 北京 100091;国家林业局林木培育重点实验室, 中国林业科学研究院林业研究所, 北京 100091;南京林业大学南方现代林业协同创新中心, 江苏 南京 210037 |
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基金项目: | 中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金项目(RIf2013-11);国家自然科学基金青年项目(31400569);江苏高校协同创新计划资助项目 |
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摘 要: | 采用本地化软件BlastP对杨树全基因组数据库和GenBank数据进行搜索,根据搜索结果对毛白杨TUA基因家族进行克隆,并利用软件Clustal W和MEGA对TUA基因进行了核酸和氨基酸序列的比对分析和系统进化分析;利用SWISS-MODEL服务器对TUA的蛋白质三维结构进行模拟。结果显示:毛白杨α-微管蛋白由8个成员构成,8个成员的氨基酸序列和其它植物α-微管蛋白序列的相似性在80%以上;TUA基因可分为2个家族,每个家族成员都有其独特的内含子外显子特征;TUA蛋白的三维结构表现出极高的相似性。毛白杨TUA基因在序列和结构上都十分保守;8个TUA基因起源于2个祖先TUA基因。
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关 键 词: | α-微管蛋白 生物信息学 系统进化 三维结构模拟 |
收稿时间: | 2013/5/10 0:00:00 |
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