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| 基于Copula函数的权重基因共表达网络分析法 | |
| 引用本文： | 汪伟平,白婷,贺帅,李倩,胡动刚. 基于Copula函数的权重基因共表达网络分析法[J]. 华中农业大学学报, 2015, 34(2): 101-105 |
| 作者姓名： | 汪伟平 白婷 贺帅 李倩 胡动刚 |
| 作者单位： | 1. 北京师范大学地表过程与资源生态国家重点实验室，北京 100875; 民政部/教育部减灾与应急管理研究院，北京 100875 2. 武汉大学测绘遥感信息工程国家重点实验室,武汉,430079 3. 华中农业大学生命科学技术学院,武汉,430070 4. 华中农业大学理学院,武汉,430070 |
| 基金项目： | 国家大学生创新性实验计划项目（1210504024）；中央高校基本科研业务费专项（2013RW006）; 国家自然科学基金项目（61202305） |
| 摘 要： | 利用Frank-Copula函数构建相关系数,并应用于权重基因共表达网络分析模型的改进。同时,利用该改进模型分析小鼠基因数据,发现在相关度最大的模块中有67个基因与小鼠肥胖导致的体质量问题相关。其中,模型的筛选结果有效率为62.6%,说明其在功能基因筛选应用前景中的科学性、有效性和可行性。 |
| 关 键 词： | 权重基因共表达网格分析 相关系数 Copula函数 小鼠体质量 基因筛选 |
| 收稿时间： | 2014-04-20 |
Weighted gene co-expression network analysis based on Copula function |
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| WANG Wei-ping , BAI Ting , HE Shuai , LI Qian , HU Dong-gang. Weighted gene co-expression network analysis based on Copula function[J]. Journal of Huazhong Agricultural University, 2015, 34(2): 101-105 | |
| Authors: | WANG Wei-ping BAI Ting HE Shuai LI Qian HU Dong-gang |
| Affiliation: | WANG Wei-ping;BAI Ting;HE Shuai;LI Qian;HU Dong-gang;State Key Laboratory of Earth Surface Processes and Resource Ecology,Beijing Normal University;Academy of Disaster Reduction and Emergency Management,Ministry of Civil Affairs & Ministry of Education;State Key Laboratory of Information Engineering in Surveying,Mapping and Remote Sensing,Wuhan University;College of Life Science and Technology,Huazhong Agricultural University;College of Science,Huazhong Agricultural University; |
| Abstract: | |
| Keywords: | weighted gene co-expression network analysis correlation coefficient Copula function body-weight of mice genetic screening |
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