基于全基因组关联分析揭示肉鸡腿病发生的遗传机制 |
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引用本文: | 唐鑫鑫,郑炬梅,骆娜,营凡,朱丹,李森,刘大伟,安炳星,文杰,赵桂苹,李和刚.基于全基因组关联分析揭示肉鸡腿病发生的遗传机制[J].畜牧兽医学报,2024(1):99-109. |
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作者姓名: | 唐鑫鑫 郑炬梅 骆娜 营凡 朱丹 李森 刘大伟 安炳星 文杰 赵桂苹 李和刚 |
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作者单位: | 1. 青岛农业大学动物科技学院;2. 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所;3. 佛山市高明区新广农牧有限公司 |
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基金项目: | 国家自然科学基金(32230101);;十四五国家重点研发计划课题(2022YFF1000203); |
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摘 要: | 旨在揭示肉鸡腿病发生的遗传机制以降低肉鸡腿病发生率。采用我国自主培育的“广明2号”多品系、多世代共2 331只白羽肉鸡公鸡作为试验素材,于42日龄通过X光鉴定腿部健康状况,利用“京芯一号”55K SNP芯片对全部个体进行基因分型,使用plink运用二分类性状的逻辑回归模型(logistic regression model, LR Model)对腿部健康表型进行全基因组关联分析(genome-wide association study, GWAS)。将不同群体芯片数据合并进行质控后,保留2 330个个体(2 256只健康,74只患病)和30 414个SNPs位点用于后续分析。通过GWAS分析筛选到5个潜在SNPs位点,分布在6号和18号染色体上,分别注释到与腿病相关的3个功能候选基因TBCD、SIRT1和PBLD上。本研究为白羽肉鸡腿部健康表型提供了重要的遗传位点和候选基因,为推进肉鸡抗病育种进程提供遗传基础。
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关 键 词: | 白羽肉鸡 腿病 全基因组关联分析 候选基因 |
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