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北京黑猪AQP9和RPS10基因多态性及其与背膘厚的关联分析
引用本文:祝雪丽,张龙超,王立贤,蒲蕾,刘欣.北京黑猪AQP9和RPS10基因多态性及其与背膘厚的关联分析[J].畜牧兽医学报,2024(1):87-98.
作者姓名:祝雪丽  张龙超  王立贤  蒲蕾  刘欣
作者单位:1. 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所;2. 天津农学院动物科学与动物医学学院
基金项目:国家重点研发计划(2021YFD1301101);;国家自然科学基金(32202650);;中国农业科学院科技创新工程(ASTIP-IAS02);;国家生猪产业技术体系(CARS-35);
摘    要:旨在研究水通道蛋白9(aquaporins9,AQP9)及核糖体蛋白10(ribosomal protein S10,RPS10)基因多态性及其与北京黑猪背膘厚的相关性,以期能够获得北京黑猪背膘厚的有效标记。本研究以413头北京黑猪为研究对象,测定不同部位(肩部、6-7肋间、胸腰结合、腰荐结合)的背膘厚度。PCR扩增AQP9和RPS10基因的启动子区和外显子区序列筛选SNP位点,并将SNPs与各部位背膘厚进行关联分析。运用荧光定量PCR检测基因的差异表达。结果发现,AQP9基因启动子区有4个突变位点,其中1个SNP:rs332699245 A>C与胸腰结合处背膘厚关联显著(P<0.05),且该位点突变预测到了结合转录因子的改变;RPS10基因在3′UTR、CDS区共有8个突变位点,其中5个与背膘厚显著关联:rs80795904 C>G、rs80932213 T>C与6~7肋间背膘厚关联显著(P<0.05),rs3469834461 C>T与肩部背膘厚、四点平均背膘厚关联显著(P<0.05),rs80862457 C>T与胸腰结合处背膘厚、...

关 键 词:北京黑猪  AQP9  RPS10  背膘厚度  关联分析
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