饲喂青贮黄梁木代替青贮玉米川中黑山羊肝转录组的表达分析 |
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引用本文: | 张德安,杨若渚,刘杰,刘德武,邓铭,柳广斌,孙宝丽,郭勇庆,李耀坤.饲喂青贮黄梁木代替青贮玉米川中黑山羊肝转录组的表达分析[J].畜牧兽医学报,2024(1):232-244. |
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作者姓名: | 张德安 杨若渚 刘杰 刘德武 邓铭 柳广斌 孙宝丽 郭勇庆 李耀坤 |
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作者单位: | 1. 华南农业大学动物科学学院;2. 华南农业大学畜禽育种国家地方联合工程研究中心;3. 华南农业大学广东省农业动物基因组学与分子育种重点实验室 |
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摘 要: | 旨在分析饲喂青贮黄梁木替代50%青贮玉米的川中黑山羊肝转录组测序中差异表达的mRNA、lncRNA及其靶基因,挖掘饲喂青贮黄梁木影响川中黑山羊肝代谢的关键基因,从而探究青贮黄粱木的饲喂效果。试验共选取6只雄性健康川中黑山羊5月龄,平均体重(21.07±4.05) kg]并随机分为两组,试验组为青贮黄梁木替代50%青贮玉米组,对照组为青贮玉米组。试验期间采用全混合日粮(TMR)进行饲喂。于试验期的最后1 d对山羊进行屠宰并取其肝,提取肝组织的RNA,构建文库后使用高通量测序技术进行转录组测序,以P<0.05为阈值筛选出差异mRNA和lncRNA,进行生物学功能富集分析并构建靶向关系网络。再从差异表达lncRNA和mRNA中各随机选择3个基因,采用RT-qPCR进行验证分析。结果表明,共发现差异表达的mRNA有1 696个,其中943个上调,753个下调;差异表达lncRNA共有33个,其中22个上调,11个下调。结合差异表达lncRNA的靶基因与差异表达mRNA的交集基因的富集分析发现,NDUFA10、NDUFB11、NDUFS5参与肝功能相关的信号通路,如多糖代谢过程、葡聚糖分...
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关 键 词: | 青贮黄粱木 川中黑山羊 肝 lncRNA mRNA |
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